基因數據倉庫及其應用研究.pdf

1、本文的目標是研究生物信息數據倉庫技術，并在此基礎上建立一個統一的基因數據倉庫平臺，主要的工作包括：　　1.在分析當前生物數據庫特點的基礎上提出了使用生物信息數據倉庫技術來集成生物信息數據庫的模型。討論了生物信息數據倉庫的特點、系統結構、主題選取、數據組織等諸多問題。這不是對數據倉庫技術的簡單應用，而是結合生物數據和生物研究的特點，提出了和一般數據倉庫技術不一樣的生物信息數據倉庫的構建原則和思路。　　2.研究了生物信息數據倉庫中源數據

2、的抽取轉換和知識的動態(tài)獲取問題。分析了源數據的常用格式，設計了相應的源數據抽取轉換算法，并實現該算法為一個數據抽取-轉換模塊；討論了生物信息數據倉庫中的動態(tài)知識獲取問題，給出了一個較好的分配、集成策略，并動態(tài)地從本地或者外部數據源獲取知識?！　?.考慮到生物學家的普遍需求，本文利用上述生物信息數據倉庫技術和兩個工具模塊，構建了一個基于疾病的基因數據倉庫BioWorld，BioWorld從多個不同的生物信息數據庫中集成了包括基因、蛋白質