基于Web的藥物專利檢索系統(tǒng).pdf

1、建立基于Web的藥物專利檢索系統(tǒng)的核心問題是藥物專利中采用的族性結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)表示方法的問題.該論文系統(tǒng)的回顧了國(guó)內(nèi)外族性結(jié)構(gòu)處理的發(fā)展和現(xiàn)狀,吸取眾家之長(zhǎng),提出了族性結(jié)構(gòu)新的表達(dá)方案——數(shù)字編碼,從藥物分子的角度探討了數(shù)字編碼的理論基礎(chǔ).該處理方案首先利用SMILES線笥編碼程序?qū)Νh(huán)和非環(huán)原子,特別是對(duì)芳香環(huán)原子的識(shí)別算法,實(shí)現(xiàn)了結(jié)構(gòu)式的程序拆分,打斷結(jié)構(gòu)式中原子和鍵的連接關(guān)系,將結(jié)構(gòu)式拆分成Ring和Fragment兩類結(jié)構(gòu)片斷,利用

2、生成全結(jié)構(gòu)SMILES編碼的算法生成Ring和Fragment的唯一SMILES編碼;其次,從結(jié)構(gòu)片斷編碼中提取結(jié)構(gòu)信息,用數(shù)字表示Ring和Fragment的類型和屬性得到Ring和Fragment的數(shù)字編碼表達(dá)式;最后,分別按照預(yù)先定義的Ring和Fragment的優(yōu)先級(jí)別排列組合Ring和Fragment的數(shù)字編碼就是全結(jié)構(gòu)的數(shù)字編碼表達(dá)式,重新構(gòu)建了原結(jié)構(gòu)原子和鍵的連接關(guān)系.數(shù)字編碼將確定結(jié)構(gòu)族性化表示,將族性結(jié)構(gòu)適當(dāng)展開,用有

3、限的數(shù)字編碼表示可能包含有成百上千個(gè)確定結(jié)構(gòu)的族性結(jié)構(gòu).用面向?qū)ο蟪绦蛟O(shè)計(jì)方法(OOP)實(shí)現(xiàn)了數(shù)字編碼方案的一系列算法,用Java語(yǔ)言完成了能夠運(yùn)行于網(wǎng)頁(yè)的Applet程序StruDraw,對(duì)提問結(jié)構(gòu)式用該程序?qū)崿F(xiàn)了結(jié)構(gòu)的拆分和數(shù)字編碼.由于數(shù)字編碼規(guī)則簡(jiǎn)單,適用于藥物專利標(biāo)引,建立供檢索的藥物專利數(shù)據(jù)庫(kù).該論文基于Windows2000+ⅡS5.0平臺(tái)設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了基于Web的藥物專利檢索系統(tǒng),能夠提供確定結(jié)構(gòu)檢索確定和族性結(jié)構(gòu),族性結(jié)