比較基因組雜交技術(shù)分析橫紋肌肉瘤中染色體基因組的變化及意義.pdf

1、目的：探討橫紋肌肉瘤的基因組變化特征,比較不同融合基因表達類型、不同組織學(xué)分型、不同組織學(xué)分級以及不同臨床病理分期橫紋肌肉瘤的基因組變化差異。 方法：選用石河子大學(xué)附屬醫(yī)院和新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院外科手術(shù)切除并經(jīng)病理組織學(xué)證實的25例原發(fā)性橫紋肌肉瘤(RMS)標本,其中腺泡狀橫紋肌肉瘤(ARMS)10例,胚胎性橫紋肌肉瘤(ERMS)12例,多形性橫紋肌肉瘤(PRMS)3例。在一步法RT-PCR檢測所有標本中PAX3/7-FKH

2、RmRNA融合基因表達情況的基礎(chǔ)上,應(yīng)用比較基因組雜交技術(shù)(CGH)分析RMS基因組的變化；根據(jù)融合基因表達情況、組織學(xué)分型、臨床分期、組織學(xué)分級、性別和年齡分組,并比較不同分組的基因組變化差異。同時收集RMS細胞株A204(腺泡型)、RD(胚胎型)作為對照。所有數(shù)據(jù)資料運用SPSS13.0軟件包分析。 結(jié)果：25例RMS CGH分析結(jié)果顯示： (1)所有RMS染色體基因組均發(fā)生不同程度的變化,其中擴增最常見的是12q(

3、48％),2p(44％),8q(40％),10q(40％),1p(36％),6p(36％),9q(36％)和2q(32％),6q(32％),15q(32％),18q(32％),其中最常累及的染色體區(qū)段為2p24(36％),12q13(32％),9q21-22(28％)和6p23-ter(20％)；而缺失最常見的是3p(48％),6p(36％)和；11p(36％) (2)10例ARMS中,擴增最常見的是12q(70％),2p(50

4、％),6(50％),2q(40％),4q(40％),10q(40％)和15q(40％);缺失最常見的是3p(50％),6p(50％),1q(40％),5q(40％)；12例ERMS中,擴增最常見的是7p(50％),9q(50％),18q(50％),2p(42％)和1p(33％),8q(33％)；缺失最常見的是11p(42％)。12q13擴增在這兩組間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義,并多見于ARMS; (3)8例融合基因表達陽性的RMS中,擴

5、增最常見的是12q(87.5％),2p(50％),6(50％),2q(50％),10q(50％),4q(37.5％)和15q(37.50),缺失最常見的是3p(50％),6p(50％),5q(50％),1q(37.5％)；而其余融合基因表達陰性的RMS中,擴增最常見的是2p(41％),9q(41％),18q(41％),7p(35％)和8q(35％)。基因組缺失最常見的是11p(35％)和14q(35％)。其中12q13擴增在兩組間的差異

6、有統(tǒng)計學(xué)意義,并多見于伴有融合基因的RMS。 (4)在不同臨床分期中,9q擴增在II期和Ⅲ～IV期間差異有統(tǒng)計學(xué)意義,且多見于II期患者。 (5)6p擴增在組織學(xué)3級和臨床3-4期發(fā)生頻率較高。 (6)細胞株染色體基因組最常見的變化與RMS組織相似,包括2p22-24,12q12-14,9q21-22擴增與6p22-23,11p12-14缺失。 結(jié)論： (1)染色體2p,12q,6p,9q,10q