槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬部分種類(lèi)基因序列及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究.pdf_第1頁(yè)
已閱讀1頁(yè),還剩95頁(yè)未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡(jiǎn)介

1、槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬寄生蜂分別是粉虱和介殼蟲(chóng)的重要寄生蜂,個(gè)體微小,傳統(tǒng)形態(tài)分類(lèi)鑒定比較困難。本論文基于核糖體28S rDNA,線(xiàn)粒體COⅠ基因序列,28S rNDA和COⅠ聯(lián)合基因序列對(duì)槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬的部分種類(lèi)進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育研究。采用不破壞標(biāo)本的方法提取DNA,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物并對(duì)核糖體28S rDNA和線(xiàn)粒體COⅠ基因序列進(jìn)行測(cè)序,以花翅蚜小蜂Marietta montana作為外群,采用ClustalX(versi

2、on1.83)、MEGA6.05、PAUP4.0、MrModeltest2.3、DAMBE、MrBayes3.2等軟件對(duì)基因序列進(jìn)行處理分析,結(jié)果采用鄰接法(NJ)、最大似然法(ML)、貝葉斯法(BI)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),得出以下結(jié)論:
  1.槳角蚜小蜂28S rDNA基因序列的G+C的堿基含量60.3%(不含外群),高于A+T的堿基含量39.7%,表現(xiàn)出明顯的G+C的堿基偏向性;COⅠ基因序列A+T的堿基含量76.2%,明顯高于G

3、+C的堿基含量23.8%,表現(xiàn)出明顯的A+T的堿基偏向性,所以核基因28S rDNA與線(xiàn)粒體COⅠ基因的堿基構(gòu)成有明顯的區(qū)別;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列A+T的堿基含量56.5%,高于G+C的堿基含量43.5%,表現(xiàn)出A+T的堿基偏向性。食蚧蚜小蜂的28S rDNA基因序列的G+C的堿基含量58.8%,高于A+T的堿基含量41.2%,表現(xiàn)出G+C的堿基偏向性;COⅠ基因序列的A+T的堿基含量70.4%,明顯高于G+C的堿基含量

4、29.6%,表現(xiàn)出明顯的A+T的堿基偏向性;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的G+C的堿基含量51.6%,高于A+T的堿基含量48.4%,表現(xiàn)出略微的G+C堿基偏向性。所以食蚧蚜小蜂的核基因28S rDNA與線(xiàn)粒體基因的堿基構(gòu)成也存在明顯的區(qū)別。
  2.槳角蚜小蜂28S rDNA的轉(zhuǎn)換的頻率是顛換的1.73倍(不含外群),轉(zhuǎn)換大于顛換,轉(zhuǎn)換主要發(fā)生在T與C之間,顛換主要發(fā)生在T與G之間;COⅠ的轉(zhuǎn)換的頻率是顛換的0.60倍,

5、轉(zhuǎn)換小于顛換,轉(zhuǎn)換的發(fā)生主要在T與C之間,顛換的發(fā)生主要在T與A之間;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的轉(zhuǎn)換的頻率是顛換的1.01倍,即轉(zhuǎn)換與顛換的頻率幾乎一致。食蚧蚜小蜂28S rDNA的轉(zhuǎn)換的頻率是顛換的1.25倍,轉(zhuǎn)換大于顛換,轉(zhuǎn)換的發(fā)生主要在T與C之間,顛換的發(fā)生主要在A與T之間;COⅠ的轉(zhuǎn)換的頻率是顛換的0.44倍,轉(zhuǎn)換明顯小于顛換,轉(zhuǎn)換的發(fā)生主要在A與G之間,顛換的發(fā)生主要在T與A之間;28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序

6、列轉(zhuǎn)換的頻率是顛換的0.93倍,轉(zhuǎn)換的發(fā)生主要在C與T之間,顛換的發(fā)生主要在T與A之間。
  3.槳角蚜小蜂的28S rDNA的遺傳距離在0.000-0.098之間,COⅠ基因的遺傳距離在0.000-0.156之間,28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的遺傳距離在0.001-0.124之間,序列之間相當(dāng)保守。食蚧蚜小蜂的28S rDNA的遺傳距離在0.000-0.183之間,COⅠ基因的遺傳距離在0.000-0.173之間,28S

7、 rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列的遺傳距離在0.000-0.162之間,序列之間也是很保守的。
  4.在DAMBE進(jìn)行的堿基替換飽和性檢測(cè)各類(lèi)數(shù)據(jù)均未達(dá)到飽和,說(shuō)明可以重建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬的基于28S rDNA基因序列構(gòu)建的三種系統(tǒng)樹(shù)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本一致,基于COⅠ基因序列構(gòu)建的三種樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)存在差別,槳角蚜小蜂屬的系統(tǒng)樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的差別主要是 Eretmocerus portoricensis的聚類(lèi)位置不同,

8、而食蚧蚜小蜂屬的系統(tǒng)樹(shù)的差別是Coccophagus sp.的聚類(lèi)位置不同。
  本研究結(jié)合形態(tài)特征和基于28S rDNA基因序列、線(xiàn)粒體COⅠ序列、28S rNDA和COⅠ聯(lián)合基因序列的分子手段綜合分析槳角蚜小蜂屬和食蚧蚜小蜂屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,旨在為傳統(tǒng)形態(tài)分類(lèi)提供分子依據(jù)。本研究中槳角蚜小蜂屬的NJ樹(shù)和BI樹(shù)將各物種完全分開(kāi),并且在各樹(shù)中基于28S rDNA和COⅠ聯(lián)合基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)樹(shù)置信值高于這兩種基因序列分別構(gòu)建的系統(tǒng)

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶(hù)所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶(hù)上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶(hù)上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶(hù)因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論