基于調(diào)和函數(shù)尋找AD候選基因.pdf

1、阿爾茨海默病(Alzheimer disease，AD)是癡呆癥中最常見(jiàn)的一種，它的發(fā)病率在逐年上升存活率卻在逐年下降。然而至今，其復(fù)雜的發(fā)病機(jī)制仍不為人知，并且也沒(méi)有找到治療AD的有效措施，但是多次研究證明AD與基因有關(guān)，因此目前已有6個(gè)基因被證實(shí)與AD相關(guān)，它們是APOE、PSEN1、PSEN2和APP基因等。為找到更多的與AD有關(guān)的基因，從根本上找到治療AD的有效辦法，研究者們開(kāi)始利用基因芯片獲取基因表達(dá)數(shù)據(jù)用以研究AD。AD病是

2、由多個(gè)基因控制的疾病，要從這些數(shù)據(jù)里提取有用的信息比較困難，為了解決這一問(wèn)題，越來(lái)越多研究者設(shè)計(jì)不同算法尋找候選基因。目前的算法大多數(shù)只是對(duì)不同生病程度下的數(shù)據(jù)進(jìn)行差異化對(duì)比，從而找出可能與AD病相關(guān)的基因，但是這些方法的缺點(diǎn)是數(shù)據(jù)挖掘不完善。為了克服這個(gè)問(wèn)題，本文根據(jù)AD病可能與基因表達(dá)水平過(guò)度失衡有關(guān)的思想，利用正態(tài)分布函數(shù)和以基因與基因之間的歐式距離為自變量構(gòu)造出反映基因相關(guān)性的調(diào)和函數(shù)，從而計(jì)算出各基因與周?chē)虻南嚓P(guān)性表達(dá)值。

3、這樣就能避免直接把基因表達(dá)數(shù)據(jù)直接進(jìn)行對(duì)比，數(shù)據(jù)挖掘更完善。通過(guò)這一算法分析基因相關(guān)性數(shù)據(jù)表達(dá)值，對(duì)比在四種不同情況下基因相關(guān)性表達(dá)值變化情況。尋找出相關(guān)性變化最劇烈的基因作為識(shí)別出來(lái)的候選基因。文章最后識(shí)別出68個(gè)相關(guān)性變化最劇烈的基因基因。由于這些基因相關(guān)性表達(dá)值變化過(guò)于劇烈，因此這一部分基因很有可能與AD有直接或間接的關(guān)系。其中APOE是其中的一個(gè)，這個(gè)基因已經(jīng)被證實(shí)是AD病基因;cnr1基因在其他有關(guān)文章中提到該基因與AD病有關(guān)