基于SSR標(biāo)記的大豆遺傳圖譜構(gòu)建與重要農(nóng)藝性狀QTL定位.pdf

1、分子遺傳圖譜構(gòu)建和重要農(nóng)藝性狀QTL分析是植物基因組學(xué)研究的主要內(nèi)容和基礎(chǔ)。大豆是重要的經(jīng)濟(jì)作物，但由于其為古源四倍體，基因組含有廣泛的復(fù)制區(qū)和豐富的重復(fù)序列，這使得其遺傳圖譜的研究落后于其他作物。SSR標(biāo)記對(duì)來自不同群體的遺傳圖譜的整合起著關(guān)鍵作用。大豆基因組研究的一個(gè)重要內(nèi)容就是創(chuàng)建針對(duì)特定農(nóng)藝性狀進(jìn)行定位的群體，并以之為材料平臺(tái)對(duì)重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行基因定位。 本研究以沈農(nóng)6號(hào)為母本、OhioFG1為父本雜交得到的92個(gè)F<,

2、7>代RIL群體為材料，構(gòu)建了該群體基于SSR標(biāo)記的大豆分子遺傳圖譜，并對(duì)頂端花序和短果枝性狀、產(chǎn)量相關(guān)性狀、蛋白質(zhì)和脂肪含量、植株生長(zhǎng)性狀、莢粒性狀、葉片性狀、生育期結(jié)構(gòu)性狀等30個(gè)性狀進(jìn)行OTL定位分析，主要結(jié)果如下： 應(yīng)用在沈農(nóng)6號(hào)×OhioFG1分離的170對(duì)SSR標(biāo)記構(gòu)建一張包含27個(gè)連鎖群的大豆遺傳圖譜?？傞L(zhǎng)度為1745.5 cM，標(biāo)記間平均間距為10.5 cM。每個(gè)連鎖群上的標(biāo)記數(shù)在2～15個(gè)之間，長(zhǎng)度在1.8～1

3、68.0 cM的范圍內(nèi)。SSR標(biāo)記在本圖譜上分布較均勻，但也存在個(gè)別標(biāo)記密集的區(qū)域，位于B2、D1b、D2＿1、F、K、N等連鎖群上。平均距離最大的連鎖群為M，為19.85 cM，最小的連鎖群為O＿1，為0.90 cM。在27個(gè)連鎖群中共有31個(gè)間距大于20 cM的標(biāo)記區(qū)間，同時(shí)存在8個(gè)大的間隙。其中B2、D2、E、G、J、L、O連鎖群被分成2段，有待進(jìn)一步添加標(biāo)記。整體上，本圖譜在位置和順序上很好地符合公共遺傳圖譜。 利用所構(gòu)

4、建的遺傳圖譜應(yīng)用Windows QTL Cartographer V2.5采用復(fù)合區(qū)間作圖法對(duì)頂端花序、短果枝等30個(gè)大豆重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行了QTL定位。在LOD>2.0時(shí)共檢測(cè)到132個(gè)大豆農(nóng)藝性狀的QTL，分布在除D1a和O之外的18個(gè)連鎖群上，C1、C2、I、K、L、O連鎖群上的QTL位點(diǎn)較為密集。其中貢獻(xiàn)率大于10％的QTL為85個(gè)，貢獻(xiàn)率大于40％的QTL為11個(gè)。在兩年的試驗(yàn)中均檢測(cè)到有關(guān)頂端花序和短果枝性狀的穩(wěn)定的主效QTL

5、，這兩個(gè)性狀緊密連鎖，均受主效QTL作用和微效QTL的修飾。與株高相關(guān)QTL qPH-l-2和與主莖節(jié)數(shù)相關(guān)QTL qSNN8l-2定位于L連鎖群上的同一區(qū)間，貢獻(xiàn)率分別為45.35％和52.83％，推測(cè)其為主效基因?？刂粕诮Y(jié)構(gòu)性狀的QTL集中分布在C2和O連鎖群上，其中有關(guān)始花期、始莢期、始粒期、始熟期和生育期的1個(gè)主效OTL位于C2連鎖群上同一位置(Satt100～Satt307)，表明這5個(gè)性狀可能由同一個(gè)基因或同一簇基因控制