圈養(yǎng)大熊貓食性轉(zhuǎn)換期腸道菌群的多樣性研究.pdf

1、食性轉(zhuǎn)換期是大熊貓一生中的重要時(shí)期。圈養(yǎng)條件下，10月齡左右的亞成年大熊貓進(jìn)入食性轉(zhuǎn)換期，該階段是大熊貓由高蛋白飲食（如母乳或牛奶等）向以竹類(lèi)等高纖維素食物為主食的轉(zhuǎn)化過(guò)程。一些研究已證明食物的轉(zhuǎn)換會(huì)影響腸道微生物的組成以及宿主的抵抗力，并且大熊貓腸道菌群在降解含高纖維素的竹子中扮演了重要的角色。
　　為了探究圈養(yǎng)大熊貓食性轉(zhuǎn)換期腸道菌群的多樣性，本實(shí)驗(yàn)采用ERIC-PCR指紋圖譜技術(shù)篩選出腸道菌群多樣性高的樣品，并對(duì)篩選出來(lái)的樣

2、品構(gòu)建16SrDNA克隆文庫(kù)，采用限制性內(nèi)切酶HinfⅠ和MspⅠ對(duì)其進(jìn)行RFLP(RestrictionFragment Length Polymorphism)及測(cè)序分析。研究結(jié)果如下:
　　1.對(duì)3只大熊貓?jiān)谑承赞D(zhuǎn)換期的糞便細(xì)菌總DNA進(jìn)行ERIC-PCR指紋圖譜分析，通過(guò)圖譜相似性及多樣性篩選出多樣性較高的樣品(F6、F7、G8、J9、G10、J11、J12)。
　　2.通過(guò)構(gòu)建食性轉(zhuǎn)換期大熊貓腸道菌群的克隆文庫(kù)及對(duì)

3、文庫(kù)進(jìn)行RFLP分析，共獲得787個(gè)陽(yáng)性克隆子，產(chǎn)生224個(gè)OTUs。構(gòu)建的文庫(kù)覆蓋率都大于78.5％，說(shuō)明所構(gòu)建的克隆文庫(kù)具有良好的代表性。Shannon index(H')，Simpsonindex(1/D)，SChaol(S)三個(gè)多樣性指數(shù)都表明食性轉(zhuǎn)換期大熊貓腸道菌群多樣性豐富，且食性轉(zhuǎn)換前期和食性轉(zhuǎn)換后期大熊貓腸道菌群的多樣性高于食性轉(zhuǎn)換中期。
　　3.16S rDNA序列分析發(fā)現(xiàn)食性轉(zhuǎn)換期大熊貓腸道菌群歸為硬壁菌門(mén)、變