長雄蕊野生稻分蘗角度和枝梗角度QTL定位及遺傳分析.pdf

1、水稻（Oryza sativa）是世界一半以上人口的主食，如何提高水稻單位面積產量一直是科學研究與育種研究關注的重點。株型是一個與水稻產量密切相關的農藝性狀，其中，分蘗角度與水稻株型建成直接相關，枝梗角度與水稻穗部疏密程度密切相關。因此，分蘗角度和枝梗角度是兩個重要的農藝性狀。
　　本研究利用長雄蕊野生稻和粳稻品種中花11雜交構建F2作圖群體，考察各單株分蘗角度和枝梗角度;用均勻覆蓋水稻基因組的125對多態(tài)性分子標記，構建了長雄蕊

2、野生稻InDel分子連鎖圖譜;利用QTL分析軟件QTLIciMapping4.0，采用完備CIM(Inclusive Composite Interval Mapping，ICIM)方法對水稻分蘗角度和枝梗角度進行QTL初步定位及遺傳分析，主要結果如下:
　　1、兩親本分蘗角度和枝梗角度差異極顯著，分蘗角度分別為41.67±12.50°和4.22±0.83°，枝梗角度分別為41.67±5.59°和0±0°。F2群體分蘗角度和枝梗角

3、度呈連續(xù)分布，說明分蘗角度和枝梗角度性狀屬于數(shù)量性狀。
　　2、利用930對覆蓋水稻全基因組的InDel分子標記對親本進行多態(tài)性檢測，共篩選到125對均勻分布于12條染色體上的多態(tài)性InDel分子標記，構建了一張遺傳圖距總長為1455.3cM，分子標記間平均遺傳距離為11.6cM的長雄蕊野生稻遺傳連鎖圖譜。
　　3、共檢測到3個與分蘗角度相關的QTLs(qTA-1-1、qTA-3-1和qTA-7-1)，分別位于1、3和7號染

4、色體上，共解釋了20.98％的表型變異率，其中，qTA-1-1可以解釋6.41％的表型變異，是一個新發(fā)現(xiàn)的分蘗角度QTL;qTA-7-1解釋了7.84％的表型變異，包含了一個普通野生稻分蘗角度調控基因PROG1。對親本進行比較測序，發(fā)現(xiàn)PROG1編碼區(qū)有一個18bp的InDel、15bp的InDel、兩個3bp的InDel和5個SNP差異，該差異造成長雄蕊野生稻和中花11中PROG1編碼蛋白的不同;
　　4、共檢測到3個與枝梗角度

5、相關的QTLs（qBA-2-1、qBA-4-1和qBA-7-1），分別位于2、4和7號染色體上，共解釋了19.58％的表型變異率。在檢測到的3個QTLs中，qBA-2-1和qBA-7-1是新檢測到的枝梗角度QTL基因座。另外一個QTLs位點與已克隆或精細定位的QTL位置相同或相近。
　　本研究未檢測到分蘗角度和枝梗角度主效QTL，調控分蘗角度和枝梗角度性狀的QTLs分布于在多條染色體上，構建了第一張高密度長雄蕊野生稻InDel標記