計算機(jī)輔助設(shè)計極光激酶抵制劑的研究.pdf

1、眾所周知,癌癥是目前致死率較高的疾病,因此,迫切需要發(fā)現(xiàn)新的藥物來治療腫瘤以治愈或減輕癌癥病人的疾病和痛苦。極光激酶家族是一類重要的絲氨酸／蘇氨酸激酶,包括極光激酶A、B、C三個家族成員,其具有控制細(xì)胞有絲分裂的作用。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),在多種腫瘤病癥中極光激酶均有過表達(dá)現(xiàn)象出現(xiàn),而且極光激酶A和B已經(jīng)被作為抗癌藥物設(shè)計的靶標(biāo),本文主要對極光激酶的抑制劑進(jìn)行了研究。
　　 第一部分:用自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和支持向量機(jī)的方法分別建立了極光激酶抑

2、制劑的選擇性的分類模型。這些模型可以很好的將極光激酶抑制劑的選擇性劃分為三個類別,即:對極光激酶A有選擇性抑制,對極光激酶B有選擇性抑制和沒有明顯選擇性抑制。兩類模型的預(yù)測正確率分別是:自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法對訓(xùn)練集為97.0％,對測試集為88.9％；支持向量機(jī)方法對訓(xùn)練集為95.5％,對測試集為100％。
　　 第二部分:用自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和支持向量機(jī)方法分別建立了148個極光激酶A分子抑制劑的分類模型,所建立的分類模型可以有效的區(qū)

3、分抑制劑的高低活性。兩個模型的預(yù)測正確率分別是:自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法對訓(xùn)練集為96.6％,對測試集為90.0％；支持向量機(jī)方法對訓(xùn)練集為93.2％,對測試集為93.3％。這兩個模型均可以用來篩選現(xiàn)有的已知數(shù)據(jù)庫來發(fā)現(xiàn)可能的新的具有高活性的先導(dǎo)化合物。
　　 第三部分:建立了117個極光激酶A抑制劑生物活性(IC50)的四個定量關(guān)系預(yù)測模型。整個數(shù)據(jù)集用了兩種不同的方法來劃分訓(xùn)練集和測試集,一種為隨機(jī)選擇方法,另一種為基于自組織神經(jīng)