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文檔簡(jiǎn)介
1、表型性狀的準(zhǔn)確記錄及其有效管理和分析是選育優(yōu)良畜禽品種(系)工作的一項(xiàng)重要內(nèi)容。東北農(nóng)業(yè)大學(xué)肉雞腹脂率雙向選擇系(Northeast Agricultural University High and Low Fa,NEAUHLF)進(jìn)行了20多年的選育工作,并積累了大量同肉雞脂肪沉積的分子遺傳基礎(chǔ)研究相關(guān)的表型性狀記錄。為了有效和系統(tǒng)地存儲(chǔ)、管理、分析和利用這些表型數(shù)據(jù),本研究設(shè)計(jì)并構(gòu)建了東北農(nóng)業(yè)大學(xué)肉雞腹脂率雙向選擇系群體表型數(shù)據(jù)庫(kù)管理
2、系統(tǒng)(NEAUHLFPhenome Database,NEAUHLFPD)。該數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)存儲(chǔ)記錄了多項(xiàng)表型性狀記錄信息和數(shù)據(jù),還可伺時(shí)滿(mǎn)足篩選、檢索和計(jì)算等功能。數(shù)據(jù)庫(kù)的具體內(nèi)容、設(shè)置以及功能相關(guān)信息如下:
一、NEAUHLFPD表型數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋的主要表型記錄和信息
(1)1-17世代系譜記錄:具體涉及家系編號(hào)、個(gè)體序號(hào)、個(gè)體編號(hào)、父母代編號(hào)、全同胞家系編號(hào)、半同胞家系編號(hào)等;
(2)29項(xiàng)表型數(shù)據(jù):分別
3、為雞體尺性狀、不同周齡體重性狀、屠體性狀以及腹脂率、肝脂率、內(nèi)臟比率等性狀信息。
二、NEAUHLFPD表型數(shù)據(jù)庫(kù)的架構(gòu)和設(shè)計(jì)過(guò)程
(1)架構(gòu)信息:選擇Apache環(huán)境作為NEAUHLFPD表型數(shù)據(jù)庫(kù)搭建的WEB服務(wù)器;選擇MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)軟件作為數(shù)據(jù)庫(kù)搭建工具;選擇Navicat作為數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具;選擇PHP作為動(dòng)態(tài)交互性站點(diǎn)創(chuàng)建的服務(wù)器端腳本語(yǔ)言;選擇HTML作為超文本標(biāo)記語(yǔ)言。
(2)結(jié)構(gòu)信息:主
4、界面上有數(shù)據(jù)庫(kù)整體組成及功能詳細(xì)介紹,以及數(shù)據(jù)庫(kù)各部分基本結(jié)構(gòu)的索引按鈕。數(shù)據(jù)庫(kù)功能模塊主要包含兩方面內(nèi)容。第一模塊,為表型(phenotype)數(shù)據(jù)的物理存儲(chǔ)空間,主要用于實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)指標(biāo)的選定、范圍設(shè)定、篩選、和查找等功能;第二模塊,為表型數(shù)據(jù)的基本描述性統(tǒng)計(jì)計(jì)算(descriptive statistics),主要用于實(shí)現(xiàn)對(duì)條件篩選后的數(shù)據(jù)進(jìn)行基本統(tǒng)計(jì)量(平均數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差、方差、眾數(shù)以及中位數(shù)等)的計(jì)算,同時(shí)還可實(shí)現(xiàn)對(duì)篩選數(shù)據(jù)的按條件排
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