15872.擬南芥wrky基因家族的進(jìn)化研究

1、擬南芥擬南芥WRKY基因家族的進(jìn)化研究基因家族的進(jìn)化研究WRKYgenefamilyevolutioninArabidopsisthaliana學(xué)科專(zhuān)業(yè)：制藥工程研究生：郝博濟(jì)指導(dǎo)教師：白鵬教授天津大學(xué)化工學(xué)院二零一三年十一月擬南芥WRKY基因家族的進(jìn)化研究摘要WRKY基因編碼一類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子家族，該家族成員具有鋅指結(jié)構(gòu)的DNA結(jié)合域，特征序列包含60個(gè)氨基酸殘基，其中含有WRKY結(jié)構(gòu)域。許多WRKY蛋白在植物應(yīng)答環(huán)境信號(hào)刺激反應(yīng)過(guò)程中起著

2、重要的作用。但WRKY蛋白的功能分化是否主要由適應(yīng)選擇或松散選擇有關(guān)依然是一個(gè)疑問(wèn)。為此，本文使用數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的WRKY序列來(lái)研究該家族的分子進(jìn)化模型，并進(jìn)行了嚴(yán)密的數(shù)據(jù)分析。非同義突變與同義突變的比值表明，在基因家族復(fù)制分化的過(guò)程中，快速的分化和純化選擇促使形成了不同的亞家族及功能分化。本文還運(yùn)用位點(diǎn)模型、枝位點(diǎn)模型從DNA水平對(duì)WRKY家族進(jìn)行了全面的選擇壓力分析。為了克服DNA水平分析的弊端以及增加說(shuō)服力，本文又采用了DIVERG