玉米自交系萌發(fā)特性的評(píng)價(jià)及SNP關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、本研究通過室內(nèi)重復(fù)可靠的萌發(fā)試驗(yàn)，篩選玉米自交系萌發(fā)期干旱脅迫和鹽脅迫條件下的鑒定指標(biāo)，建立快速可靠地玉米自交系萌發(fā)期抗旱性、抗鹽性評(píng)價(jià)體系，對(duì)培育優(yōu)良的雜交種、穩(wěn)定玉米生產(chǎn)具有重要意義。同時(shí)，選用172份玉米自交系為材料，篩選得到均勻分布于玉米10條染色體上的SNP標(biāo)記，分析玉米自交系的遺傳結(jié)構(gòu)和群體結(jié)構(gòu)，用關(guān)聯(lián)分析的方法篩選與玉米自交系萌發(fā)性狀相關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記。
　　1.根據(jù)對(duì)15％PEG干旱脅迫處理與CK的各指標(biāo)分析，篩選出

2、用于評(píng)價(jià)干旱脅迫條件下玉米自交系萌發(fā)特性指標(biāo):相對(duì)發(fā)芽率及相對(duì)活力指數(shù)在權(quán)重系數(shù)分別為0.6和0.4時(shí)，聚類結(jié)果最好，自交系可以分為高抗、抗、中抗、低抗、不抗5大類;根據(jù)聚類后各類型的特性，建立了玉米萌發(fā)期間抗旱能力評(píng)價(jià)的判別函數(shù):Y=0.6RGR+0.4RVI，建立的判別函數(shù)可對(duì)玉米自交系萌發(fā)時(shí)期的抗旱性進(jìn)行評(píng)價(jià)與篩選。
　　2.根據(jù)對(duì)0.8％NaCl鹽脅迫處理與CK的各指標(biāo)分析，篩選出用于評(píng)價(jià)鹽脅迫條件下玉米自交系萌發(fā)特性指標(biāo)

3、:相對(duì)發(fā)芽率及相對(duì)活力指數(shù)在權(quán)重系數(shù)分別為0.6和0.4時(shí)，聚類結(jié)果最好，自交系可以分為高抗、抗、中抗、低抗、不抗5大類;根據(jù)聚類后各類型的特性，建立了玉米萌發(fā)期間耐鹽能力評(píng)價(jià)的判別函數(shù):Y=0.6RGR+0.4RVI，建立的判別函數(shù)可對(duì)玉米自交系萌發(fā)時(shí)期的耐鹽性進(jìn)行評(píng)價(jià)與篩選。
　　3.從56，110個(gè)SNP標(biāo)記中篩選獲得35171個(gè)具有高質(zhì)量和多態(tài)性SNP標(biāo)記，堿基變化涉及A/C(4231)、A/G(14138)、A/T(24

4、3)、T/A(212)、T/C(12054)、T/G(3676)、C/G(353)、G/C(264)8種，其中A/G類型最多，在所有類型中占40.20％，第1號(hào)染色體分布最多，為4926個(gè)SNP，占總標(biāo)記數(shù)多的14.01％，其余染色體分布范圍在6.04％-12.45％。
　　4.利用35171個(gè)SNP標(biāo)記對(duì)238個(gè)自交系連鎖不平衡分析表明，關(guān)聯(lián)分析群體有很高的連鎖不平衡水平，但不同染色體上衰減距離差異較大。6號(hào)染色體的衰減距離最小

5、僅為0.66 Kb，1、3、4、7、9和10號(hào)染色體的衰減距離在2.139 Kb至6.186 Kb之間，2、5、7號(hào)染色體的衰減距離均大于10 Kb，其中2號(hào)染色體的衰減距離最大達(dá)到22.384 Kb。
　　5.遺傳結(jié)構(gòu)分析將172個(gè)自交系可分為塘四平頭群、P群、改良Reid和其它4個(gè)類群。其它群多為我國近10年引入國外新種質(zhì)的改良系，對(duì)該類群種質(zhì)遺傳特性和種質(zhì)類群特性的深入研究或?qū)?huì)為以后的玉米遺傳育種起到重要的指導(dǎo)作用。

6、>　　6.基于MLM的關(guān)聯(lián)分析表明，在考慮群體結(jié)構(gòu)的情況下，在P≤0.001水平下，干旱脅迫條件下與相對(duì)發(fā)芽率、相對(duì)活力指數(shù)、綜合指標(biāo)關(guān)聯(lián)SNP標(biāo)記分別為20、53、41個(gè);鹽脅迫條件下與相對(duì)發(fā)芽率、相對(duì)活力指數(shù)、綜合指標(biāo)關(guān)聯(lián)SNP標(biāo)記分別為分別為15、8、11個(gè);在干旱脅迫條件下有16個(gè)SNP標(biāo)記同時(shí)與兩個(gè)性狀關(guān)聯(lián)，有1個(gè)SNP標(biāo)記同時(shí)與三個(gè)性狀關(guān)聯(lián);在鹽脅迫條件下有11個(gè)SNP標(biāo)記同時(shí)與兩個(gè)性狀關(guān)聯(lián)，有3個(gè)SNP標(biāo)記同時(shí)與三個(gè)性狀關(guān)