SSR標記與玉米自交系主要性狀的關聯(lián)分析.pdf

1、一些重要的分子標記對玉米遺傳性狀的改良非常重要。本研究目的在于發(fā)掘與產(chǎn)量相關性狀顯著關聯(lián)的位點，對分子標記輔助育種有重要的指導意義。以94份玉米自交系為試驗材料，對調(diào)查的26個表型性狀進行表型多樣性分析；在分子水平上，用204對SSR引物對其進行遺傳多樣性、群體結構和SSR標記間的連鎖不平衡(LD)分析；最后，運用基于全基因組掃描的關聯(lián)分析策略尋找與產(chǎn)量相關性狀顯著關聯(lián)的位點，研究結果主要有以下幾個方面：
　　 1.對該群體材料

2、調(diào)查的26個表型性狀進行表型多樣性分析。用SPSS軟件對2010年和2011年兩年性狀做相關分析。然后對兩年性狀的均值進行統(tǒng)計分析。軸重的變化范圍為7.56-48.37g，變幅最大，平均值為23.97g，變異系數(shù)為37.88％。成熟期的變化范圍為87.107天，變幅最小，平均值為97天，變異系數(shù)為4.76％。該群體材料26個性狀均符合正態(tài)分布。這一變化反映出我們的群體材料有廣泛的表型多樣性，并且可以用做關聯(lián)分析。
　　 2.利用

3、均勻分布于玉米10條染色體的204對SSR引物對94份玉米自交系進行遺傳多樣性分析。結果表明，204對引物共檢測到1286個等位變異，平均每個標記6.3個等位變異，變化范圍為2-16個。PIC值和基因多樣性值在每條染色體上分布均勻，平均值分別為0.61和0.66?；蚨鄻有缘淖畲笾禐?.8849，PIC值的最大值為0.8738，材料特性豐富。這表明本研究群體材料的遺傳多樣性較高。
　　 3.群體結構分析表明，當△k=5時，得到最

4、優(yōu)分群結果，可以將自交系劃分為5大種質(zhì)類群，且分別對應于我國玉米自交系的五大雜種優(yōu)勢群：旅大紅骨、四平頭、PB、Reid和BSSS群。以遺傳相似性比例Q≥70％為劃分標準，有73.4％的自交系被歸到相應的類群中，而其他材料遺傳相似比例<0.70。
　　 4.篩選與自交系性狀顯著關聯(lián)的SSR位點。在P<0.05水平下，2010年和2011年分別有417和347個標記和所有的性狀關聯(lián)，兩年性狀數(shù)據(jù)均值的關聯(lián)位點有318個。2010和

5、2011年相同的關聯(lián)位點有39個，這39個關聯(lián)位點與兩年數(shù)據(jù)均值的關聯(lián)位點相比較，發(fā)現(xiàn)25個重復的關聯(lián)位點。在P<0.01水平下，2010年和2011年分別有138和96個標記與26個性狀關聯(lián)，兩年性狀均值的關聯(lián)位點有106個。2010年和2011年只有6個重復的關聯(lián)位點。而這6個關聯(lián)位點與兩年數(shù)據(jù)均值比較得到3個重復的關聯(lián)位點。找到了一些強的關聯(lián)位點，如在P<0.01水平下，umc1917分別和散粉期(AD)和百粒重(HKW)相關聯(lián)，

6、umc1397分別和軸粗(CD)和出籽率(KRO)相關聯(lián)，在P<0.001水平下，umc2025和軸粗(CD)關聯(lián)。發(fā)現(xiàn)了一些新的關聯(lián)位點，如bnlg2162，bnlg1118，phi077，nmc1161和苞葉長(BYC)相關聯(lián)，bnlg1118和成熟期綠葉數(shù)(GLN)相關聯(lián)。
　　 5.探討遺傳距離與產(chǎn)量雜種優(yōu)勢的關系，發(fā)現(xiàn)遺傳距離與畝產(chǎn)量存在顯著相關，相關系數(shù)為r=0.45**，建立數(shù)學模型y=0.3442x3-9.969

7、x2+9.729x-2.089。遺傳成分△Q值與畝產(chǎn)量也存在顯著相關，r=0.50**，建立數(shù)學模型y=-0.069x3-0.136x2+0.399。昌7-2是典型的SPT群，而齊319是典型的PB群，其遺傳距離較遠為1.1049，因而其組配的雜交種的畝產(chǎn)量屬于高產(chǎn)組合。一些遺傳距離比較近的自交系，其組配的雜交種，被歸為了低產(chǎn)組合。Reid和SPT，Reid和LRC，SPT和PB群組配的雜交組合產(chǎn)量較高。本研究結果對育種實踐有一定的指導