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文檔簡(jiǎn)介
1、方氏云鳚(Pholis fangi)與云鳚(Pholis nebulosa)同屬于鱸形目(Perciformes)、鳚亞目(Blennoidei)、錦鳚科(Pholidae)、云鳚屬(Pholis),為冷溫性底層魚類,方氏云鳚主要分布于黃、渤海,云鳚在黃、渤海以及東海均有分布。本研究綜合運(yùn)用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)標(biāo)記以及線粒體DNA分子標(biāo)記,研究了方氏云鳚和云鳚的群體遺傳結(jié)構(gòu)、歷史動(dòng)態(tài)以及遺傳多樣性現(xiàn)狀,并對(duì)方氏云鳚與云鳚種間差異進(jìn)行了探討。
2、> 利用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法,對(duì)4個(gè)不同地理群體方氏云鳚的10個(gè)可數(shù)性狀和13個(gè)可量性狀進(jìn)行了比較研究。分節(jié)特征方面與以往的分類學(xué)資料相一致,方氏云鳚群體的各分節(jié)性狀值分布范圍大致相當(dāng),難以作為劃分不同群體的依據(jù);對(duì)量度特征的主成分分析、判別分析、單因子方差分析等結(jié)果顯示各群體間存在顯著差異。
為研究方氏云鳚的群體遺傳多樣性水平、遺傳結(jié)構(gòu)現(xiàn)狀及其群體動(dòng)態(tài)歷史,擴(kuò)增并分析了9個(gè)地理群體的方氏云鳚控制區(qū)片段序列、COI序列和Cyt b
3、序列。在控制區(qū)片段分析中,共檢測(cè)181個(gè)個(gè)體,得到25個(gè)單倍型,表現(xiàn)出中等程度的單倍型多樣性和偏低的核苷酸多樣度。分子方差分析(AMOVA)和兩兩群體相比較的FST結(jié)果顯示方氏云鳚在所研究范圍內(nèi)不存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu)。中性檢驗(yàn)和核苷酸不配對(duì)分布分析的結(jié)果表明方氏云鳚在晚更新世時(shí)經(jīng)歷過群體擴(kuò)張事件。在COI序列和Cyt b序列分析中,得到了與控制區(qū)片段分析相類似的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。同時(shí),我們擴(kuò)增了方氏云鳚的線粒體控制區(qū)全序列(853bp),對(duì)照其他
4、已報(bào)道的魚類控制區(qū)結(jié)構(gòu),分析了方氏云鳚的線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)。識(shí)別出了終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū),并找到與終止命令相關(guān)的TAS序列以及保守序列(CSB-F、CSB-E、CSB-D、CSB-C、CSB-B、CSB-A、CSB-1、CSB-2、CSB-3)。
采用多元數(shù)理統(tǒng)計(jì)分析方法探討了采自分別長(zhǎng)海和俚島的2個(gè)云鳚群體間的形態(tài)差異。結(jié)果顯示,不同群體的分節(jié)特征分布范圍大致相當(dāng),分節(jié)特征難以作為云鳚群體劃分的指標(biāo)。而不同群體間
5、在可量性狀上存在一定程度的分化。
采用線粒體DNA控制區(qū)部分序列對(duì)云鳚群體遺傳結(jié)構(gòu)和群體動(dòng)態(tài)歷史進(jìn)行了研究,在云鳚群體內(nèi)檢測(cè)到了兩個(gè)單倍型類群的存在,更新世冰期時(shí)海平面下降,使西北太平洋邊緣海之間產(chǎn)生隔離,可能是兩個(gè)單倍型類群之間發(fā)生分化的原因。云鳚群體呈現(xiàn)中等程度的單倍型多樣性和較高的核苷酸多樣度,兩兩群體相比較的FST結(jié)果群體間不存在顯著的遺傳分化,F(xiàn)S檢驗(yàn)和Tajima’s D檢驗(yàn)以及核苷酸不配對(duì)分布結(jié)果均表明云鳚群體經(jīng)
6、歷過群體擴(kuò)張事件。同樣,我們擴(kuò)增了云鳚線粒體控制區(qū)全序列(853bp),識(shí)別出了終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū),云鳚的線粒體控制區(qū)結(jié)構(gòu)與方氏云鳚的研究結(jié)果相似。
基于傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)標(biāo)記和線粒體DNA分子標(biāo)記對(duì)方氏云鳚和云鳚間的差異進(jìn)行比較。采用主成分分析、判別分析和聚類分析對(duì)采自北黃海的方氏云鳚群體和大連長(zhǎng)海的云鳚群體形體特征進(jìn)行了分析,方氏云鳚和云鳚間存在明顯的差異。而在分節(jié)特征方面,方氏云鳚和云鳚各指標(biāo)的范圍存在一定的交疊
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