HDAC1基因多態(tài)位點與肉牛部分經(jīng)濟性狀的相關性分析.pdf

1、組蛋白去乙?；?HDAC)與基因的轉(zhuǎn)錄活性有著密切關系,轉(zhuǎn)錄活躍區(qū)的核小體組蛋白呈高度乙酰化,而不活躍的染色質(zhì)呈去乙?；癄顟B(tài)。組蛋白去乙?；诨蜣D(zhuǎn)錄、信號轉(zhuǎn)導、個體發(fā)育、細胞增殖和分化中至關重要。
　　本實驗以15頭南陽黃牛和37頭西門塔爾牛為研究材料,以HDAC1基因為南陽牛和西門塔爾牛經(jīng)濟性狀的候選基因,采用 PCR-SSCP和DNA PCR產(chǎn)物直接測序等技術,檢測了HDAC1基因3'-UTR、Intron4-Intron

2、5、Intron10-Intron11基因序列的單核苷酸多態(tài)性(SNP),并分析該基因多態(tài)性與南陽黃牛和西門塔爾牛經(jīng)濟性狀的關聯(lián)性,以期為西門塔爾牛和南陽黃牛新品系的培育及品種改良等提供理論參考,加速良種肉牛的繁育。本研究的主要實驗結(jié)果如下:
　　1. PCR擴增得到南陽黃牛和西門塔爾牛 HDAC1基因的Intron4-Intron5250bp,Intron10-Intron11276bp和3‘UTR非翻譯區(qū)368bp的DNA片段

3、。
　　2.應用PCR-SSCP技術和PCR產(chǎn)物直接測序法,發(fā)現(xiàn)南陽牛和西門塔爾牛的HDAC1基因Intron4-Intron5片段中均沒有核苷酸多態(tài)性位點。
　　3.在南陽黃牛和西門塔爾牛群體中,HDAC1 Intron10-Intron11的102bp處均存在A/G突變位點,為同義突變。南陽黃牛純合子GG基因型頻率最大,純合子AA基因型最小;而在西門塔爾牛中,AG雜合子頻率分別大于兩種純合子頻率。在兩種牛群中,G等位基因

4、均占多數(shù)。將該核苷多態(tài)性位點與經(jīng)濟性狀進行關聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):AG基因型的南陽黃牛,腰角寬顯著長于AA基因型個體(P<0.05),且該位點的顯性效應也達到顯著水平;西門塔爾牛中,AA基因型個體的背膘厚度性狀低于GG和AG型個體,差異顯著(P<0.05),該突變位點對背膘厚度指標的基因加性效應達到了顯著水平(P<0.05)。
　　4.南陽黃牛HDAC1的3‘非翻譯區(qū)存在兩個突變,第50bp處A/C多態(tài)性位點,存在的兩種基因型中AA型基因型

5、頻率大于AC型;第199bp處的T/C多態(tài)性位點,群體中也只存在兩種基因型,且TT基因型頻率大于TC型;在這兩個SNP中,A核苷等位基因均占到80％左右。而在西門塔爾牛群體中,HDAC1基因3‘非翻譯區(qū)沒有發(fā)現(xiàn)多態(tài)性位點。
　　5.分析南陽黃牛3‘端非翻譯區(qū)A/C多態(tài)性位點與生長性狀關聯(lián)性發(fā)現(xiàn):AC基因型個體在體長性狀、體高和十字部高均都顯著高于AA基因型個體(P<0.05),而T/C位點對南陽黃牛的生長性狀無顯著性影響。