基于線粒體控制區(qū)序列和AFLP分析我國沿海棘頭梅童魚群體遺傳結(jié)構(gòu).pdf

1、棘頭梅童魚Collichthys lucidus ( Richardson)屬鱸形目Perciformes、石首魚科Sciaenidae、梅童魚屬Collichthys，是我國沿海重要的小型經(jīng)濟(jì)魚類。采用PCR擴(kuò)增測序法獲得了棘頭梅童魚南通、啟東、蘆潮港、溫州、瑞安、福州、番禺7個(gè)地理群體53尾魚mtDNA控制區(qū)全序列。棘頭梅童魚控制區(qū)序列長度為778-782bp，序列長度變異主要是由位點(diǎn)的插入/缺失造成，識別了終止序列區(qū)TAS和保守序

2、列區(qū)CSB1, CSB2和CSB3序列。共檢測到多態(tài)位點(diǎn)66個(gè)，占全部序列8.44％，檢測到單倍型33種，平均單倍型多樣性為0.9347±0.0175，平均核苷酸多樣性為0.0175±0.0023。棘頭梅童魚群體內(nèi)的遺傳距離(K2-P )為0.0017～0.0228，群體間的遺傳距離為0.0023～0.0433，群體間的分化指數(shù)FST為-0.0584～0.8458，基因流為0.05～19.62。AMOVA分析結(jié)果顯示，群體間的變異為74

3、.21％，群體內(nèi)的變異為25.79％ (P<0.05)，表明群體間發(fā)生了顯著的遺傳分化。以NJ法構(gòu)建的親緣關(guān)系樹顯示，棘頭梅童魚7個(gè)群體分為兩個(gè)大支，一支以北方類群(南通、啟東、蘆潮港、溫州群體)個(gè)體為主，另一支以南方類群(福州和番禹群體)個(gè)體為主，瑞安群體與兩大類群有交叉。
　　 利用AFLP技術(shù)分析了我國沿海棘頭梅童魚8個(gè)地理群體(山東榮成、江蘇南通、啟東、上海蘆潮港、浙江溫州、瑞安、福建福州和廣州番禺)的遺傳結(jié)構(gòu)特征。10

4、對引物組合在8個(gè)群體160尾個(gè)體中共擴(kuò)增出272個(gè)位點(diǎn)，多態(tài)位點(diǎn)72個(gè)，多態(tài)位點(diǎn)比例為26.47％。8個(gè)地理群體的多態(tài)位點(diǎn)比例、Nei遺傳多樣性指數(shù)分別為8.82％～15.07％、0.0291～0.0514，表明棘頭梅童魚群體遺傳多樣性水平較低。AMOVA分析表明，群體間差異對群體遺傳總變異的貢獻(xiàn)率為47.91％，群體內(nèi)差異的貢獻(xiàn)率為52.09％，群體間、群體內(nèi)均存在顯著差異。8個(gè)群體間的遺傳分化指數(shù)FST為0.1151～0.5995(