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1、鳳丹(Paeonia suffruticosa Andr.)為芍藥科多年生植物,是一種重要的傳統(tǒng)中藥資源。在其生長(zhǎng)發(fā)育的周期中與土壤微生物尤其是根際土壤微生物有密切的關(guān)系。本文通過構(gòu)建16S rRNA基因克隆文庫(kù)及文庫(kù)的限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(ARDRA),對(duì)中國(guó)藥用植物鳳丹(P. suffruticosa)5大主要分布區(qū)域的根際土壤細(xì)菌群落多樣性進(jìn)行了研究。采用限制性內(nèi)切酶HinfI和Csp6I對(duì)克隆文庫(kù)中的1000個(gè)克隆子進(jìn)行了酶
2、切分型,根據(jù)酶切圖譜的不同,可將其分為324個(gè)OTUs,并挑選相應(yīng)的代表克隆子進(jìn)行了測(cè)序和系統(tǒng)發(fā)育分析。16S rRNA基因序列分析結(jié)果表明,鳳丹主要產(chǎn)區(qū)根際土壤細(xì)菌種群主要包括α-,β-,γ-和δ-Proteobacteria,Acidobacteria,Actinobacteria,Bacteroidetes,Verrucomicrobia,Gemmatimonadetes,Chloroflexi,TM7,Nitrospirae,F(xiàn)
3、irmicutes和Planctomycetes的14個(gè)類群,此外還有部分未歸類細(xì)菌。其中Proteobacteria(α,γ,βandδ)為優(yōu)勢(shì)菌群,其次是Acidobacteria和 Actinobacteria。Pseudomonas sp.、Burkholderia sp.和Arthrobacter sp.為優(yōu)勢(shì)菌屬。通過PCR-DGGE法對(duì)丫山不同生長(zhǎng)年限、不同生長(zhǎng)時(shí)期鳳丹根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化規(guī)律進(jìn)行研究,結(jié)果表明種植鳳丹
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