河南省豬2型圓環(huán)病毒分子流行病學調(diào)查.pdf

1、豬2型圓環(huán)病毒（Porcinecircovirustype2，PCV2）不僅是仔豬斷奶多系統(tǒng)衰竭綜合征的主要病原體，而且還引起一系列圓環(huán)病毒相關疾病（porcinecircovirus-associateddisease，PCVAD）。PCV2能夠使感染豬免疫功能受到損害，這種可導致機體免疫抑制的病毒經(jīng)常以亞臨床感染的形式出現(xiàn)，常易被忽視。因此應當進一步加強對PCV2的流行病學研究。 為了了解PCV2在河南省豬群中的感染情況以及

2、PCV2河南株的起源和遺傳變異，本研究采用PCR診斷技術對所收集的361份疑似豬圓環(huán)病毒相關疾病的病料進行檢測，得到256份PCV2陽性病料，并用其中的部分病料進行了PCV2的分離、增殖。PCR檢測結果顯示2007～2008年河南豬群中PCV2總體陽性率高達70.9％。采用反向PCR技術，從河南省不同地區(qū)臨床表現(xiàn)不同的病豬中擴增、克隆了11株PCV2的全基因組，對其進行了序列測定，得到長度為1767bp的目的基因片段。應用PHYLIP和

3、CLUSTALX分析軟件，使用Boot-strappedNeighbor-Joining算法，基于51株PCV（49株PCV2和2株PCV1）全基因組序列進行比較，并生成系統(tǒng)進化樹。結果表明PCV2在該進化樹主要分為兩大群：美國群和歐洲群，但是PCV2各分離株之間存在著某種地理區(qū)域上的相關性。河南株之間以及與中國其他地區(qū)PCV2流行株同源性均很高（98.1％～99.7％）；河南株均處于歐洲分支中。提示PCV2河南株可能起源于歐洲株：河南

4、省不同年份的PCV2中確實存在一定的基因差異（98.0％～99.7％），但PCV2全基因組從總體上來說遺傳進化相對穩(wěn)定；河南省豬群中的PCVAD不是由PCV2變異毒株引起的。 應用DNAStar序列分析軟件對所測定的11株PCV2序列進行同源性分析。結果顯示，11株之間的核苷酸同源性為98.0％～99.7％。進一步分析三個主要閱讀框ORF1、ORF2和ORF3并推導其氨基酸序列，河南株ORF1的核苷酸及氨基酸序列的同源率分別為9

5、7.0％～99.8％和96.5％～99.7％；河南株ORF2之間的核苷酸及氨基酸同源率分別為98.9％～100％和97.9％～99.6％。Cap蛋白氨基酸變異大于Rep蛋白，與國外已發(fā)表毒株的ORF2比較，發(fā)現(xiàn)變異主要發(fā)生在三個區(qū)域，其中兩個與病毒的抗原表位相對應，推測這些變異可能與PCV2抗原性的改變有關，而Rep蛋白非常保守，這與其功能有關。河南株ORF3之間的核苷酸及氨基酸同源率分別為97.1％～100％和84.8％～99.0％，