大白菜抗病和晚抽薹性狀的GWAS分析及其優(yōu)異資源發(fā)掘.pdf

1、蔬菜品種抗逆性、抗病性和品質(zhì)的優(yōu)劣是其成敗的要素。而相關性狀優(yōu)異基因資源發(fā)掘是實現(xiàn)分子育種的基礎。本研究以203份來源廣泛、類型豐富的大白菜高代自交系為試材，進行了耐抽薹性和5種主要病害抗病性的人工控制環(huán)境下的鑒定，篩選出一批優(yōu)良的大白菜育種材料；根據(jù)核心種質(zhì)的重測序結果，開發(fā)了覆蓋全基因組的SNP標記，并開展了全基因組關聯(lián)分析，以挖掘控制這些性狀的候選區(qū)段；對28份大白菜自交系或雜交組合進行感官品質(zhì)和營養(yǎng)品質(zhì)評價，并分析了兩者的關系，

2、為大白菜育種提供借鑒。主要研究結果如下：
　　1.在6類不同形態(tài)類型的大白菜種質(zhì)中，以合抱卵圓型材料的晚抽薹性最好；獲得14份晚抽薹材料，其中以07-458和12-577開花最遲，從春化結束到開花分別需53天和41天。
　　2.獲得高抗霜霉病、病毒病、黑腐病、黃萎病和根腫病的材料分別有7、3、0、28和12個；兼抗2~4種病害的材料共計93個，并從中篩選到12-85、13-108和09-894等15個綜合抗病性表現(xiàn)優(yōu)異的自交

3、系材料。
　　3.基于10個核心種質(zhì)的重測序數(shù)據(jù)，開發(fā)了覆蓋全基因組的1040個SNP標記，并對203份材料進行基因分型和遺傳結構分析；群體被劃分為4個亞群，分別是合抱卵圓類亞群、疊抱平頭類亞群、疊抱直筒類亞群和混合類型亞群；親緣關系分析表明，自交系間兩兩親緣關系系數(shù)在0.2以下的超過92％，表明群體親緣關系較遠。
　　4.選用182份自交系材料組成的自然群體開展晚抽薹和5種病害的全基因組關聯(lián)分析，分別獲得與耐抽薹性、開花天

4、數(shù)、霜霉病、病毒病、黑腐病、黃萎病和根腫病抗性顯著關聯(lián)的5、2、2、5、2、5和8個共計29個位點或熱點區(qū)，為進一步發(fā)掘候選基因提供了依據(jù)。
　　5.以28個自交系或品種為試材，篩選出了7個感官品質(zhì)較好的自交系材料，并分析得到感官品質(zhì)回歸方程：生食綜合yr=0.3103+0.254x1（多汁度）+0.1762x2（甜度）+0.2216x3（脆度）+0.3199x4（鮮味），熟食綜合yc=0.2044+0.2509x5（渣量）+0.