基于線粒體COI序列的泥螺系統(tǒng)地理學(xué)研究.pdf

1、本文采用分子系統(tǒng)地理學(xué)的研究方法，以分子遺傳標(biāo)記技術(shù)，檢測了采自我國寧波、舟山、東營、萊州、黃島、溫州、大連、連云港、南通等九個地區(qū)沿海潮間帶的泥螺樣品，進(jìn)行了線粒體DNA COI(cytochromec oxidase I)序列的遺傳變異分析，以闡明不同地區(qū)泥螺群體的系統(tǒng)地理格局、種群遺傳結(jié)構(gòu)及其遺傳多樣性現(xiàn)狀，探討其遺傳變異分布格局的形成及其維持機(jī)制，以及影響其系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu)的因素。研究結(jié)果可對我國泥螺種群進(jìn)行較準(zhǔn)確的劃分和判別，并為

2、外來物種的入侵評價奠定基礎(chǔ)，為今后合理保護(hù)、科學(xué)管理和開發(fā)利用泥螺種質(zhì)資源提供重要遺傳依據(jù)。
　　對163條610bp長度的線粒體DNA COI序列進(jìn)行分析，包括種群遺傳多樣性的分析，各個種群的單倍型數(shù)目、單倍型多樣性、核苷酸多樣性、多態(tài)性位點(diǎn)、兩兩群體之間的核苷酸差異數(shù)分析；種群遺傳分化分析，包括群體之間遺傳距離、種群之間的遺傳分化指數(shù)；分子方差分析(AMOVA)總體遺傳分化各參數(shù)等；進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系分析，包括單倍型網(wǎng)絡(luò)圖、基于

3、總體和單倍體構(gòu)建各種種群系統(tǒng)發(fā)育樹等，根據(jù)遺傳結(jié)構(gòu)和各參數(shù)分析影響種群發(fā)展歷程的因素等。
　　主要研究結(jié)果如下：
　?。?）比對后所得到的163條COI片段長610個堿基，有80個變異位點(diǎn)，占總位點(diǎn)數(shù)的13％。在總?cè)后w中發(fā)現(xiàn)了54種單倍型，其中種群間共享單倍型有14種，它們來自于70.5%的樣本個體，40種單倍型為種群特有單倍型。但并不是所有群體都存在一個共有的單倍型，多數(shù)群體只和部分種群存在交叉?？傮w的核苷酸多樣性（ND）

4、為0.016±0.008，單倍型多樣性（HD）為0.925±0.011。單個種群核苷酸多樣性范圍為0.001~0.419，單倍型多樣性范圍為0.431~0.902。除了舟山、寧波群體具有較低的核苷酸多樣性外，其它七個群體都具有較高的單倍型多樣性以及核苷酸多樣性。
　?。?）系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析結(jié)果表明，單倍型的聚類與地理分布沒有顯著的相關(guān)性。構(gòu)建的泥螺單倍型網(wǎng)絡(luò)圖顯示出2個大枝，其中一個分枝源于9個地理種群的25種單倍型，共103個個

5、體，占總體數(shù)目的63%；另一分枝來自7個地理種群的29種單倍型，共60個個體，占總體數(shù)目的37%。建立的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖形成的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和分枝內(nèi)部的單倍型組成與前面的系統(tǒng)發(fā)育樹類似，沒有明顯的地理圖譜?；趥€體構(gòu)建的NJ樹，整體也分為2個大枝，各地理群體的個體彼此相互交叉，個體在系統(tǒng)發(fā)育樹中的分布與地理分布也不一致。綜上證明，泥螺沒有顯著的系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu)。
　?。?）將本研究中的泥螺九個地理種群分為一個大組或按省份分為四個組，AMOVA結(jié)