基于cpDNA序列的小葉錦雞兒分子譜系地理學(xué)研究.pdf

1、為探索我國小葉錦雞兒系統(tǒng)發(fā)育地理模式，選取內(nèi)蒙古高原分布的小葉錦雞兒（Caraganamicrophylla Lam.）8個種群（共157個個體）為實驗材料，對其葉綠體DNA的非編碼區(qū)序列trnL-trnF和psbA-trnH進(jìn)行測序，通過分析cpDNA序列變異來獲得單倍型類型，并計算遺傳多樣性指標(biāo)（包括單倍型多樣性指數(shù)Hd和核苷酸多樣性指數(shù)π）;分析小葉錦雞兒種群結(jié)構(gòu)，建立N-J聚類圖;基于最大簡約標(biāo)準(zhǔn)構(gòu)建小葉錦雞兒種內(nèi)譜系的單倍型網(wǎng)

2、絡(luò)圖，并推測種群間的親緣關(guān)系。主要結(jié)果如下:
　　(1)分析小葉錦雞兒cpDNA非編碼區(qū)序列trnL-trnF和psbA-trnH測序結(jié)果，發(fā)現(xiàn)序列總長為1244-1250bp，共檢測到三處變異位點，這三個變異位點組合獲得五種單倍型:H1、H2、H3、H4和H5，其中含有單倍型H3的樣本數(shù)最多（共75個個體），含單倍型H2的樣本數(shù)最少(6個個體)。8個種群總樣本的單倍型多樣性指數(shù)Hd為0.674，核苷酸多樣性指數(shù)π值為0.0008

3、9。
　　(2)種群遺傳分化系數(shù)分析結(jié)果為Fst=0.38755(P=0.0000)，說明在全部樣本中變異來源于種群間的比例占38.755％，變異來源于種群內(nèi)的比例為61.245％，小葉錦雞兒遺傳變異主要來源于種群內(nèi)部，但種群間也出現(xiàn)一定程度的分化(38.755％)。
　　(3)8個小葉錦雞兒種群共形成了兩大單源群，第一個單源群包括分布在烏蘭察布市四子王旗、化德縣、察哈爾右后旗和錫林郭勒盟正鑲白旗、多倫縣、鑲黃旗的種群;第二

4、個單源群包括分布在錫林郭勒盟東烏旗、呼倫貝爾市新巴爾虎左旗的種群。其中來自烏蘭察布市四子王旗化德縣和呼倫貝爾市新巴爾虎左旗包含的單倍型類型完全不同，因此分別位于N-J進(jìn)化樹的兩端，親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。
　　(4)呼倫貝爾市新巴爾虎左旗、錫林郭勒盟東烏旗的種群（含H4、H5）處于進(jìn)化第一階梯;錫林郭勒盟多倫縣的種群（含H3、H4、H5）、錫林郭勒盟正鑲白旗的種群（含H2、H3、H4）處于進(jìn)化第二階梯;烏蘭察布市四子王旗的種群（含H1、H2