知識發(fā)現(xiàn)工具scifinder入門_第1頁
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文檔簡介

1、楊眉高分子化學(xué),知識發(fā)現(xiàn)工具SciFinder入門,誰能讀這么多? 誰需要讀這么多? 發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新是不是一個數(shù)字的游戲?,“首先必需認識到,科研工作者都十分寶貴自己的時間,除極少數(shù)和自己工作關(guān)系十分密切的論文以外,絕大多數(shù)讀者都不會閱讀全文?!? 鄒承魯 “我的科學(xué)之路”,2003年10月,序言:為什么我們需要知識發(fā)現(xiàn)工具?,內(nèi)容綱要,12/04/2014,3,SciFinder的前世今生,12/04/2014,4,S

2、ciFinder的前世今生,12/04/2014,5,SciFinder與CA(CD/Print)的區(qū)別,SciFinder的前世今生,12/04/2014,6,覆蓋多個學(xué)科傳統(tǒng)化學(xué)有機化學(xué)、高分子、應(yīng)用化學(xué)和化學(xué)工程、物理化學(xué)、無機化學(xué)和分析化學(xué)。生命科學(xué)遺傳學(xué), 基因組學(xué), 酶學(xué), 蛋白質(zhì)組學(xué), 實驗內(nèi)科學(xué), 生物化學(xué), 生物技術(shù)學(xué), 分子生物學(xué), 微生物學(xué), 細胞生物學(xué) ,藥理學(xué)等,SciFinder的前世今生,數(shù)據(jù)多元化

3、CA(1907-)Medline醫(yī)學(xué)庫專利全文(歐洲、美國等61家機構(gòu)授權(quán))180多國的文獻50多個語種,12/04/2014,7,SciFinder的前世今生,12/04/2014,8,SciFinder涵蓋了化學(xué)相關(guān)領(lǐng)域超過98%的文獻,溶劑,催化劑,產(chǎn)率等,SciFinder的前世今生,SciFinder內(nèi)容模塊,12/04/2014,9,SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑,文獻檢索(References)CAPLUSSM

4、 文摘數(shù)據(jù)庫Medline National Library of Medicine數(shù)據(jù)庫物質(zhì)檢索(Substances)CAS REGISTRYSM 物質(zhì)數(shù)據(jù)庫CHEMCATS--商業(yè)來源數(shù)據(jù)庫CHEMLIST--管制數(shù)據(jù)庫反應(yīng)檢索(Reaction)CASREACT 化學(xué)反應(yīng)數(shù)據(jù)庫,12/04/2014,10,SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑,,12/04/2014,11,SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑,知識發(fā)現(xiàn)目標(biāo)

5、:獲得不知道的信息知識發(fā)現(xiàn)過程,12/04/2014,12,SciFinder初體驗,SciFinder Web的系統(tǒng)要求Windows用戶支持IE 7.x或者FireFox 2.xMac 用戶支持 Firefox 和 Safari首次需注冊@sjtu.edu.cnOR@shsmu.edu.cnJava 安裝(初次畫分子結(jié)構(gòu)時提示)信息來源:圖書館主頁,12/04/2014,13,SciFinder初體驗,通過圖書館主

6、頁獲取相關(guān)信息www.lib.sjtu.edu.cn,12/04/2014,14,,,SciFinder初體驗,進入數(shù)據(jù)庫介紹頁面,12/04/2014,15,,,SciFinder初體驗,進入數(shù)據(jù)庫介紹頁面,12/04/2014,16,,,SciFinder初體驗,進入數(shù)據(jù)庫介紹頁面,12/04/2014,17,,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/2014,18,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/

7、2014,19,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/2014,20,交大郵箱醫(yī)學(xué)院郵箱,,,,便于找回密碼,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/2014,21,,通過鏈接確認,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫登錄(http://scifinder.cas.org),12/04/2014,22,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫主界面,12/04/2014,23,,,,,,保存過的結(jié)果集,郵件提醒結(jié)果集,,

8、3個主要檢索入口及檢索選項,,,,對多個檢索式進行邏輯運算,,實戰(zhàn)演練,文獻檢索主題檢索例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究物質(zhì)檢索標(biāo)示符檢索例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析結(jié)構(gòu)式檢索例3: 結(jié)構(gòu)檢索反應(yīng)檢索官能團檢索例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng),12/04/2014,24,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究策略制定nanostructured materials of pharmaceutic

9、als檢索結(jié)果,12/04/2014,25,,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,12/04/2014,26,,,,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,12/04/2014,27,,,,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,12/04/2014,28,一共12種分析方式,一共6種精煉途徑,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)

10、域的研究結(jié)果分析與精煉,12/04/2014,29,,,,12/04/2014,30,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,,,12/04/2014,31,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,,,12/04/2014,32,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,,12/04/2014,33,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的

11、研究結(jié)果分析與精煉,,12/04/2014,34,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,,,12/04/2014,35,實戰(zhàn)演練:文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領(lǐng)域的研究結(jié)果分析與精煉,,,文獻類型,內(nèi)容分類,實戰(zhàn)演練:文獻檢索小結(jié),構(gòu)建主題檢索策略以介詞連接主要檢索詞能夠自動識別同義詞,近義詞,縮寫,并有截詞,斷詞等功能選擇恰當(dāng)?shù)慕Y(jié)果集合使用分析精煉功能縮小范圍學(xué)會Analyze/Ref

12、ine功能的組合使用使用Categorize自動分類通過跳轉(zhuǎn)獲取更多信息可實現(xiàn)從文獻到物質(zhì),反應(yīng),引文的跳轉(zhuǎn),12/04/2014,36,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析baidu獲取物質(zhì)信息紫杉醇: Paclitaxel , TAXOL…CAS No: 33069-62-4,12/04/2014,37,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析檢索獲得物質(zhì)詳細信息,12/04/201

13、4,38,檢索框,可輸入物質(zhì)學(xué)名、俗名、CAS No等信息,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析檢索獲得物質(zhì)詳細信息,12/04/2014,39,,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析查看生物活性,12/04/2014,40,,,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析查看靶點,12/04/2014,41,,,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索精確結(jié)構(gòu)檢索亞結(jié)構(gòu)檢索相似

14、結(jié)構(gòu)檢索Markush檢索,12/04/2014,42,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3: 結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,43,,畫圖版,用于輸入結(jié)構(gòu)式,,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,不需要安裝JAVA的結(jié)構(gòu)編輯器,12/04/2014,44,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,需要安裝JAVA的結(jié)構(gòu)編輯器,12/04/2014,45,,輸入物質(zhì)信息獲取結(jié)構(gòu)式,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索繪制結(jié)構(gòu)式,12/04/2014,46,,,實戰(zhàn)演

15、練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索選擇立體構(gòu)型匹配度,12/04/2014,47,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—精確結(jié)構(gòu)檢索得到物質(zhì)的鹽、聚合物、混合物或者配合物等等,12/04/2014,48,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,49,33069-62-4,,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,50,,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)

16、檢索得到物質(zhì)的所有修飾信息1547條,12/04/2014,51,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—亞結(jié)構(gòu)檢索分析與精煉,12/04/2014,52,八大限定結(jié)構(gòu)再次限定同位素限定金屬包含限定商業(yè)化限定可提供性質(zhì)限定性質(zhì)數(shù)據(jù)限定可提供參考限定原子附屬性限定,六大分析生物活性分析商業(yè)化分析元素分析反應(yīng)可行性分析物質(zhì)角色分析靶點分析,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,5

17、3,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,54,,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,55,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—相似結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,56,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索特定物質(zhì)[Specific Substance] 以特定化學(xué)結(jié)構(gòu)所陳述的特定物質(zhì),會被標(biāo)示CAS No.預(yù)測性物質(zhì)[Prophet

18、ic Substance]不會被標(biāo)示CAS No. 一個Markush可以陳述上百或上千的化學(xué)物質(zhì)找到其他途徑無法檢索到的專利幫助進行初步的專利評估,12/04/2014,57,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,58,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,59,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索,12/04/20

19、14,60,,實戰(zhàn)演練:物質(zhì)檢索,例3:結(jié)構(gòu)檢索—Markush結(jié)構(gòu)檢索,12/04/2014,61,,實戰(zhàn)演練:結(jié)構(gòu)檢索小結(jié),精確結(jié)構(gòu)檢索:結(jié)果包含鹽和混合物等,母體結(jié)構(gòu)不能修改,不能修飾亞結(jié)構(gòu)檢索:結(jié)構(gòu)必須存在,母體結(jié)構(gòu)不能修改,但可以被修飾相似結(jié)構(gòu)檢索:母體結(jié)構(gòu)可修改可被修飾,給出相似度Markush檢索:獲得專利文獻中的預(yù)測性物質(zhì),12/04/2014,62,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng),12/04/

20、2014,63,,,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng)acid halide ——aldehyde,12/04/2014,64,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng),12/04/2014,65,,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng),12/04/2014,66,,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng),12/04/2014,67,,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反

21、應(yīng)分析與精煉,12/04/2014,68,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng)產(chǎn)率〉70%的反應(yīng),12/04/2014,69,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應(yīng)以Pd為催化劑的反應(yīng),12/04/2014,70,實戰(zhàn)演練:反應(yīng)檢索小結(jié),官能團反應(yīng)適用于只涉及基團之間變化的反應(yīng),可獲得更多參考信息多用Analyze/Refine,來獲得催化劑,溶劑,產(chǎn)率等信息當(dāng)無法找到具體反應(yīng),或者檢索結(jié)果并不滿意,

22、嘗試用亞結(jié)構(gòu)反應(yīng)查 詢,可以獲得更多的參考信息,12/04/2014,71,課程小結(jié)與習(xí)題,全面檢索,避免漏檢數(shù)據(jù)庫后臺支持多級精煉,層層篩選組合運用精煉、分析等多種后處理功能不斷修正策略與結(jié)構(gòu)找不到反應(yīng),或檢索結(jié)果不盡如人意時,12/04/2014,72,課程小結(jié)與習(xí)題,更多參考信息iGroup(http://www.igroup.com.cn/cas/)更多案例上海辦公室: 021-64453167小木蟲論壇(ht

23、tp://emuch.net/bbs/)檢索求助,12/04/2014,73,課程小結(jié)與習(xí)題,習(xí)題1:文獻檢索的入口有幾個?請給 出數(shù)據(jù)庫中的具體名稱。習(xí)題2:如何檢索青蒿素的合成方法? 2種及以上途徑可獲加分。附加題:你了解SciFinder的特殊功能么?舉1個例子即可獲得加分!提示:請?zhí)峤煌暾倪^程信息提交郵箱:myans@sjtu.edu.c

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