外文醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫

1、外文醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫,主講人: 李薇,Pubmed,PubMed ? PubMed數(shù)據(jù)庫簡(jiǎn)介? PubMed數(shù)據(jù)范圍? PubMed主頁? PubMed檢索方法 ? 檢索結(jié)果的處理,PubMed是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館NLM所屬的國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）開發(fā)的一個(gè)以Web方式向用戶提供服務(wù)的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)，是目前世界上查找醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)利用率最高的網(wǎng)上免費(fèi)數(shù)據(jù)庫,一、PubMed數(shù)據(jù)庫簡(jiǎn)介,二、

2、PubMed的數(shù)據(jù)范圍,? 出版商提供的書目信息,? PreMedline,? OLDMEDLINE(1950-1965),? MEDLINE,學(xué)科范圍：基礎(chǔ)生命科學(xué)臨床生命科學(xué) 生物科學(xué) 解剖學(xué)組織學(xué)化學(xué)與藥物心理學(xué)社會(huì)醫(yī)學(xué)農(nóng)業(yè) 醫(yī)技設(shè)備學(xué) 　醫(yī)技工業(yè)學(xué) 醫(yī)學(xué)信息學(xué)使用詞表

3、：MeSH（醫(yī)學(xué)主題詞表）,收錄范圍：來源于美國和世界上70多個(gè)國家和地區(qū)、50種語言的7395種權(quán)威生物醫(yī)學(xué)及相關(guān)學(xué)科期刊，內(nèi)容涉及生物醫(yī)學(xué)各個(gè)領(lǐng)域；85%以上原文為英語，80%記錄有文摘，5%免費(fèi)全文。目前記錄已達(dá)約2200萬條，約40萬篇/年 ?；厮輹r(shí)間：1966年至今。記錄中有[indexed for MEDLIEN]標(biāo)記,MEDLINE數(shù)據(jù)庫簡(jiǎn)介,一種由正在加工處理中的文獻(xiàn)記錄組成的數(shù)據(jù)庫，這些新記錄還未被或正在標(biāo)引，暫時(shí)

4、存放在PreMEDLINE數(shù)據(jù)庫中。每天更新，經(jīng)過標(biāo)引（增加主題詞、文獻(xiàn)類型、數(shù)據(jù)庫存取號(hào)等字段）以后轉(zhuǎn)入Medline，一旦記錄被轉(zhuǎn)入到Medline數(shù)據(jù)庫，就被從PreMEDLINE數(shù)據(jù)庫中刪除。記錄中有[PubMed-in process]的標(biāo)記。,PreMEDLINE,Pre-Medline最新信息,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,,,一周以后,出版商提供的書目信息(Publi

5、sher-Supplied Citation),出版商直接向PubMed提供的非Medline收錄的電子刊物，記錄標(biāo)有[Record as supplied by publishers]標(biāo)記。（如：Science或Nature中的地質(zhì)學(xué)文獻(xiàn)等）。,標(biāo)記不同，出自分庫亦不同,獲取生物醫(yī)學(xué)權(quán)威期刊最多 世界上70多個(gè)國家的7395種權(quán)威期刊多種檢索方法，多條檢索途徑時(shí)效性極強(qiáng)(每周更新)回溯年代久遠(yuǎn)（1950年至今）利用Me

6、SH作為轉(zhuǎn)換詞表，標(biāo)引質(zhì)量高部分文獻(xiàn)可以免費(fèi)獲取全文檢全率、檢準(zhǔn)率高,PubMed簡(jiǎn)介,PubMed主頁,進(jìn)入途徑：http://www.pubmed.com http://www.pubmed.gov http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez,三、PubMed的檢索途徑和方法 基本檢索

7、 高級(jí)檢索 主題檢索 期刊檢索 專用檢索,16,Pubmed 主頁界面http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/,基本檢索輸入框,,檢索限制,高級(jí)檢索,常用工具,其他資源：,個(gè)人空間,使用幫助,,,1、邏輯運(yùn)算符：OR、AND、NOT 運(yùn)算順序：OR<AND<NOT，可用（）改變檢索詞的

8、 處理順序。2、截詞符：*eg: cell*：cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等詞的文獻(xiàn)。3、利用字段標(biāo)識(shí)符進(jìn)行限定檢索： 檢索式格式：檢索詞A[字段標(biāo)識(shí)B]，檢索在字段中含有檢索詞A的文獻(xiàn)。 如： hepatitis[TI]，smith [AU] 。4、“ ”，將短語做為不可分割的整體

9、進(jìn)行檢索。 如：“OXYGEN FREE RADICALS ”注意： [ ]和“ ”必須為英文或中文半角。,檢索運(yùn)算符,,Pubmed簡(jiǎn)單檢索實(shí)例例一     查找有關(guān)“肝癌和肝炎的關(guān)系”的文獻(xiàn)，英文“l(fā)iver cancer ” 和 “hepatitis”,檢索文獻(xiàn)數(shù)量,,,題錄格式內(nèi)容,,,,,在西文文獻(xiàn)里，著者的署名一般名在前姓在后，例:著者“Henry Hemila”應(yīng)轉(zhuǎn)換

10、成“ Hemila h”,后加著者字段限定來檢索，注意：姓在前，名在后 姓全稱，名縮寫,作者限定字段檢索,例二 查找作者 Hemila h著作的文獻(xiàn),三、PubMed的檢索途徑和方法 基本檢索 高級(jí)檢索 主題檢索 期刊檢索 專用檢索,,,,檢索史,字段選擇,點(diǎn)擊Edit可編輯檢索框里面的策略式,

11、四、PubMed的檢索途徑和方法 基本檢索 高級(jí)檢索 主題檢索 期刊檢索 專用檢索,PubMed主題詞檢索,MeSH（Medical Subject Headings）即醫(yī)學(xué)主題詞，是用規(guī)范化的醫(yī)學(xué)術(shù)語來描述生物醫(yī)學(xué)概念。NIH的工作人員按MeSH詞表規(guī)定，瀏覽生物醫(yī)學(xué)期刊全文后標(biāo)引出每篇文獻(xiàn)中的MeSH主題詞，其中論述文

12、獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞（major topic headings），論述主題某一方面的內(nèi)容的詞稱為副主題詞（Subheadings）。,Mesh Database醫(yī)學(xué)主題詞表,《醫(yī)學(xué)主題詞表》是對(duì)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析、標(biāo)引和檢索的權(quán)威性詞表。功能：確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞、擴(kuò)展下位主題詞、指定主要主題詞,進(jìn)入途徑：,,,MeSH Database：例1：從主題途徑查找FK506副作用

13、例2：從主題途徑查找腎移植的文獻(xiàn),,檢索流程第一步：主題分析 英文轉(zhuǎn)換FK506 adverse effectskidney transplantation點(diǎn)擊MeSH Database Mesh界面 輸入檢索詞 Go,,,,,第二步：選定該主題詞 主題詞輪排表點(diǎn)擊該主題詞 主題詞細(xì)節(jié)屏,,,,,,主題詞輪排表,他克莫司,第三步：主題詞細(xì)節(jié)屏（主

14、題詞詞義注釋、副主題詞、加權(quán)或不擴(kuò)展、入口詞、曾用詞、樹狀結(jié)構(gòu)） 選擇合適的副主題詞 選擇加權(quán)或不擴(kuò)展 send to,,,,主題詞細(xì)節(jié)屏,主題詞詞義注釋,,副主題詞選擇,,,加權(quán)檢索,不擴(kuò)展檢索,,入口詞,,曾用詞,,藥理作用,,樹狀結(jié)構(gòu),,點(diǎn)擊搜索生成器,第四步：search box 點(diǎn)擊 search PubMed 檢索結(jié)果,,,,點(diǎn)擊搜索PUBME

15、D,,題錄格式界面,,,,邏輯組配（#5 and #7）,,,,Pubmed主題詞檢索的功能： （1）理解詞義和收入詞表的時(shí)間 （2）限定副主題詞 ，提高查準(zhǔn)率。    （3）加權(quán)檢索，提高查準(zhǔn)率。   （4）了解樹形結(jié)構(gòu),擴(kuò)展檢索，提高查全率 （5）了解同義詞，提高查全率。,PubMed的檢索途徑和方法 基本檢索

16、 高級(jí)檢索 主題檢索 期刊檢索 專用檢索,,Journal Database (期刊數(shù)據(jù)庫) 可輸入刊名全稱、縮寫或國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號(hào)（ISSN)檢索特定期刊的編目信息；,,引文匹配器使用欄位化的檢索方式，找尋特定刊名、卷期、作者、篇名的文獻(xiàn)資料。,,PubMed 一、PubMed數(shù)據(jù)庫簡(jiǎn)介二、PubMed數(shù)據(jù)范圍三、PubMed主頁四、P

17、ubMed檢索方法 五、檢索結(jié)果的處理,檢索結(jié)果處理,檢索結(jié)果的顯示與標(biāo)記 檢索結(jié)果的保存及定購,,,,結(jié)果排序方式,每頁顯示記錄數(shù),結(jié)果顯示格式,檢索結(jié)果顯示默認(rèn)為題錄格式每頁顯示20條記錄,,,純文本方式顯示,純文本顯示記錄,文摘顯示格式,MEDLINE格式,,,,,可鏈接到SpringerLink數(shù)據(jù)庫獲取全文,可鏈接到PubMed中心獲取免費(fèi)全文,全文鏈接圖標(biāo),,,選擇“File”，可完成將記錄