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文檔簡介
1、用NTSYSpc2.10e制作聚類圖(實例講解)1.在EXCEL表中先建立一個0,1構(gòu)成的矩陣:按如下規(guī)則輸入數(shù)據(jù),A1=1表示有帶記為1,B1=38表示AFLPSSRRFLP有38個條帶,C1=60表示樣本數(shù),D1=0表示無帶記為0。如圖(每個列為一個樣本的條帶情況):2.將EXCEL數(shù)據(jù)復制粘貼到文本格式,命名保存sz2.txt。3.打開ntsys軟件的將文本文件導入軟件中:點Similarity選中Qualitativedatai
2、nputfile欄導入保存的sz2.txt。在Outputfile欄輸入sz3,點Compute,會出現(xiàn)一個報告:4.點Clustering選SAHNinputfile欄導入sz3.NTSOutputtreefile欄輸入sz4點Compute,又會出現(xiàn)一個報告:因為默認設置顯示樣本數(shù)是30,需改變設置為60點聚類圖的Options選plotoptions在Phenogram中的OTUspage欄改30為60:點OK全部樣本的聚類圖就出
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