分子標(biāo)記輔助選擇

1、第十七章分子標(biāo)記輔助選擇育種傳統(tǒng)的育種主要依賴于植株的表現(xiàn)型選擇(Phenotypiealion)。環(huán)境條件、基因間互作、基因型與環(huán)境互作等多種因素會(huì)影響表型選擇效率。例如抗病性的鑒定就受發(fā)病的條件、植株生理狀況、評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)等影響；品質(zhì)、產(chǎn)量等數(shù)量性狀的選擇、鑒定工作更困難。一個(gè)優(yōu)良品種的培育往往需花費(fèi)7～8年甚至十幾年時(shí)間。如何提高選擇效率，是育種工作的關(guān)鍵。育種家在長(zhǎng)期的育種實(shí)踐中不斷探索運(yùn)用遺傳標(biāo)記來提高育種的選擇效率與育種預(yù)見性。

2、遺傳標(biāo)記包括形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記與分子標(biāo)記。棉花的芽黃、番茄的葉型、抗TMV的矮黃標(biāo)記、水稻的紫色葉鞘等形態(tài)性狀標(biāo)記，在育種工作中曾得到一定的應(yīng)用。以非整倍體、缺失、倒位、易位等染色體數(shù)目、結(jié)構(gòu)變異為基礎(chǔ)的細(xì)胞學(xué)標(biāo)記，在小麥等作物的基因定位、連鎖圖譜構(gòu)建、染色體工程以及外緣基因鑒定中起到重要的作用，但許多作物難以獲得這類標(biāo)記。生化標(biāo)記主要是利用基因的表達(dá)產(chǎn)物如同工酶與貯藏蛋白，在一定程度上反映基因型差異。它們?cè)谛←湣⒂衩椎茸?/p>

3、物遺傳育種中得到應(yīng)用。但是它們多態(tài)性低，且受植株發(fā)育階段與環(huán)境條件及溫度、電泳條件等影響，難以滿足遺傳育種工作需要。以DNA多態(tài)性為基礎(chǔ)的分子標(biāo)記，目前已在作物遺傳圖譜構(gòu)建、重要農(nóng)藝性狀基因的標(biāo)記定位、種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析與品種指紋圖譜及純度鑒定等方面得到廣泛按照PCR所需引物類型又可分為：①單引物PCR標(biāo)記，其多態(tài)性來源于單個(gè)隨機(jī)引物作用下擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度或序列的變異，包括隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA標(biāo)記(Rom別amplificationp

4、olymphismDNA，RAPD)、簡(jiǎn)單重復(fù)序列中間區(qū)域標(biāo)記(1ntersimplesequencerepeatspolymphisms，ISSR)等技術(shù)；②雙引物選擇性擴(kuò)增的PCR標(biāo)記，主要通過引物3端堿基的變化獲得多態(tài)性，這種標(biāo)記主要指擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性標(biāo)記(Amplifiedfragmentlengthpolymphisms，AFLP)；③需要通過克隆、測(cè)序來構(gòu)建特殊雙引物的PCR標(biāo)記如簡(jiǎn)單序列重復(fù)標(biāo)記(Simplesequen

5、cerepeats，SSR)、序列特征化擴(kuò)增區(qū)域(Segion，簡(jiǎn)稱SCAR技術(shù))和序標(biāo)位(Sequence—taggedsites，簡(jiǎn)稱STS)等。第三類是一些新型的分子標(biāo)記，如單核苷酸多態(tài)性(Singlenucleotidepolymphism，SNP)，由基因組核苷酸水平上的變異引起的DNA序列多態(tài)性，包括單堿基的轉(zhuǎn)換、顛換以及單堿基的插入／缺失等。表達(dá)序列標(biāo)簽(Expressedsequencestags，EST)是在cDNA文