測序常用名詞解釋整理_第1頁
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1、113高通量測序領域常用名詞解釋大全高通量測序領域常用名詞解釋大全什么是高通量測序?什么是高通量測序?高通量測序技術(Highthroughputsequencing,HTS)是對傳統(tǒng)Sanger測序(稱為一代測序技術)革命性的改變一次對幾十萬到幾百萬條核酸分子進行序列測定因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing,NGS)足見其劃時代的改變同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致

2、全貌的分析成為可能所以又被稱為深度測序(Deepsequencing)。什么是什么是SangerSanger法測序(一代測序)法測序(一代測序)Sanger法測序利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成,每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3OH基團,使延長的

3、寡聚核苷酸選擇性地在G、A、T或C處終止。終止點由反應中相應的雙脫氧而定。每一種dNTPs和ddNTPs的相對濃度可以調整,使反應得到一組長幾百至幾千堿基的鏈終止產物。它們具有共同的起始點,但終止在不同的的核苷酸上,可通313測序名詞關系圖測序名詞關系圖什么是什么是fragmentsfragmentsfragments就是打成的片段,而測序測的就是這些fragments,測出來的結果就是reads,又可以分為單端側和雙端側,單端測序的話

4、,只是從fragments的一端測序,測多長read就多長,雙端測序就是從一個fragments的兩端測,就會得出兩個reads什么是什么是ReadsReads高通量測序平臺產生的序列就稱為reads。(測序讀到的堿基序列片段,測序的最小單位;)什么是什么是ContigContig拼接軟件基于reads之間的overlap區(qū),拼接獲得的序列稱為Contig(重疊群重疊群)。(由reads通過對overlap區(qū)域拼接組裝成的沒有沒有gap

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