帶有基因型誤判的關(guān)聯(lián)分析中的反復(fù)測(cè)量方法.pdf

1、在人類遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)分析研究中，基因型誤判(genotype misclassification)是非常常見的現(xiàn)象。當(dāng)病例組和對(duì)照組所對(duì)應(yīng)的誤判模型是一致的時(shí)候，雖然Pearson x<'2>檢驗(yàn)的Ⅰ型錯(cuò)誤仍然是正確的，但是功效可能會(huì)有所降低。目前，絕大部分處理基因型錯(cuò)誤(genotypingerrors)的方法是假定誤判模型為先驗(yàn)已知，或者誤判概率模型可以通過(guò)無(wú)誤差的金標(biāo)準(zhǔn)(gold standard)的儀器測(cè)量得到。但是，在實(shí)際應(yīng)用中，

2、誤判概率通常沒有先驗(yàn)信息，另外金標(biāo)準(zhǔn)方法通常因?yàn)檫^(guò)于昂貴而無(wú)法實(shí)施。 重復(fù)測(cè)量(repeated measurement)設(shè)計(jì)提供了可以估計(jì)誤判概率的一種可行性方法。在這個(gè)設(shè)計(jì)中，當(dāng)誤判模型足完全未知的情況下，一部分研究對(duì)象需要被重復(fù)測(cè)量(5次或5次以上)。我們將這種重復(fù)測(cè)量方法應(yīng)用于基因關(guān)聯(lián)分析(genetic association analysis)?；ㄙM(fèi)-效用(cost-effectiveness)研究表明，當(dāng)測(cè)量表現(xiàn)型

3、(phenotype)與基因型(genotype)所需的費(fèi)用的比值，或者誤判率比較大的時(shí)候，重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)比常用的病例對(duì)照設(shè)計(jì)(case-control de-sign)更有效。同時(shí)，功效的增加量(power gain)對(duì)遺傳模型、遺傳相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)率(genetic relativerisk)以及總體高風(fēng)險(xiǎn)等位基因頻率(high-risk allele frequency)等因素不敏感，而這些因素在傳統(tǒng)的關(guān)聯(lián)分析中都是些重要的因素，并且在研究