蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測中的決策模型研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、結(jié)構(gòu)域是蛋白質(zhì)的亞單位,可以獨立的折疊和發(fā)展,結(jié)構(gòu)域是實現(xiàn)蛋白質(zhì)功能的最小的結(jié)構(gòu)單位。域邊界位置的確定往往是對蛋白質(zhì)功能的翻譯的第一步。ThreaDom便是一種目的于解決預(yù)測域邊界而發(fā)展出的方法,它與其他方法相比有更高的精度和召回率。
  基于ThreaDom的整體思路,在對常見的基于蛋白質(zhì)序列預(yù)測結(jié)構(gòu)域算法進行了分析與學(xué)習(xí),充分了解各個算法的優(yōu)缺點與適用領(lǐng)域后,單獨分析了需要改進的ThreaDom方法的相關(guān)方面,得出對于一些曲線

2、較為不規(guī)則的蛋白質(zhì)序列,采用固定閾值的方法準確性較低的結(jié)論,繼而提出基于機器學(xué)習(xí)和概率統(tǒng)計的方法,針對包含這些適配性較低的蛋白質(zhì)序列的方案進行決策建模。然后利用相關(guān)技術(shù)方法對特征的提取、選擇和優(yōu)化,在整個過程當(dāng)中確定最優(yōu)的閾值,與此同時,對于相似類型的序列引入了統(tǒng)計概率的方法進行改善,最后對決策樹具體層次路徑的調(diào)整,以及對具體閾值的確定做出了詳細的介紹。
  在算法研究的理論基礎(chǔ)上,實現(xiàn)了基于改進ThreaDom結(jié)果的決策方法,同

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