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文檔簡介
1、廣西大學(xué)博士學(xué)位論文菜粉蝶顆粒體病毒的分子生物學(xué)研究姓名:溫榮輝申請學(xué)位級別:博士專業(yè):微生物學(xué)指導(dǎo)教師:陳保善20070101廣西大掌博士掌位論文菜粉蝴q頁糊吖拳病毒的分子生物掣u開究組的物理圖譜。該物理圖譜與已報(bào)道的其他的PiraGV分離株的基因組物理圖譜比較,觀察到少量酶切位點(diǎn)的差異。PiraGVE3基因組中17個EcoRI位點(diǎn)中的14個與PiraGV英國分離株ArGVl基因組中19個EcoRI位點(diǎn)中的14個位點(diǎn)位置相一致,但Pi
2、raGVE3基因組中缺失了ArGVl另外的5個EcoRI位點(diǎn),同時在基因組其他位置增加了3個EcoRI位點(diǎn)。3PiraGVDNApolymerase(dnapoO基因的研究:PiraGVdnapol編碼框包含3135個核苷酸,編碼一個1045個氨基酸組成的預(yù)計(jì)分子量為12216kDa的蛋白質(zhì)。PiraGVdnapol基因與其他的桿狀病毒的dnapol基因有2870%的氨基酸同源性。與其他的桿狀病毒dnapol基因一樣,PiraGVdna
3、pol基因包含有保守的3’5’外切核酸酶的基序(motif)以及DNA結(jié)合功能域(domain)。Northern雜交顯示,在PiraGV感染的菜粉蝶幼蟲體內(nèi),咖apol基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物主要為37kb的mRNA。5’和3’cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)顯示PiraGVdnapol基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物起使于翻譯起使密碼子ATG上游378的T,終止于一個poly(A)信號序列AATAAA?;赿napol基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示PiraGV與蘋果小
4、卷葉蛾顆粒體病毒(CydiapomonellaGV,CpGV),云杉卷葉蛾顆粒體病毒(ChoristoneuraoccidentalisGV,ChocGV)和蘋果異形小卷蛾顆粒體病毒(CryptophlebialeucotretaGV,CrleGV)在進(jìn)化關(guān)系上最為密切。4PiraGV的全基因組測序:PiraGV基因組全長108476bp,堿基組成中AT含量為668%,預(yù)測PiraGV基因組含有125個orf(;,150nt),其中29
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