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文檔簡介
1、農(nóng)田土壤中鄰苯二甲酸酯(PAEs)的污染狀況日趨嚴重,直接影響農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全,嚴重危害人體健康。篩選對污染物低累積作物品種(污染安全品種)是在土壤普遍污染情況下確保農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全的重要策略。本文以我國南方地區(qū)重要蔬菜菜心(Brassica parachinensis L.)為研究對象,針對兩種典型的PAEs化合物鄰苯二甲酸二丁酯(DBP)和鄰苯二甲酸二(2-乙基)己酯(DEHP),篩選獲得對DBP和DEHP高低累積的兩個菜心品種,通過比
2、較高、低累積菜心品種植株間的PAEs富集和轉(zhuǎn)運系數(shù)、亞細胞分布、抗氧化能力、細胞超微結(jié)構(gòu)、光合作用等生理學特征及轉(zhuǎn)錄組和蛋白組水平下的分子生物學差異,揭示不同基因型菜心高、低累積PAEs性狀形成的生物學機制。本論文的主要研究結(jié)果如下:(1)PAEs高、低累積菜心品種的篩選
通過盆栽試驗研究了28種菜心在對照、低PAEs(添加DBP和DEHP各為10 mg/kg)和高PAEs(添加DBP和DEHP各為100 mg/kg)污染土壤
3、中的PAEs累積特征。在低污染下所有品種菜心地上部 PAEs含量(干重)范圍:DBP為0.101~0.373 mg/kg(最大差異為3.7倍)、DEHP為0.125~0.721 mg/kg(最大差異為5.2倍);在高污染下DBP為0.355~2.027 mg/kg(最大差異為5.3倍)、DEHP為0.783~8.527 mg/kg(最大差異為6.8倍)??梢姡煌诵钠贩N地上部 PAEs含量存在顯著差異。同時,各品種菜心對 DBP和DE
4、HP的累積量均呈顯著正相關(p<0.01),表明菜心可同時吸收這兩種化合物,且不存在競爭性累積。因此,本文篩選獲得了Lvbao70為PAEs低累積品種(簡稱LB),Huaguan為PAEs高累積品種(簡稱 HG)。通過比較這兩種菜心富集系數(shù)和轉(zhuǎn)運系數(shù),發(fā)現(xiàn)高、低累積菜心品種地上部的富集系數(shù)差異不顯著,但是低累積菜心的轉(zhuǎn)運系數(shù)(從根到地上部)顯著低于高累積菜心品種,致使更多的PAE滯留在根部,導致地上部PAEs累積較少,成為地上部低累積性
5、狀形成的關鍵因素。
?。?)高、低累積菜心品種PAEs亞細胞分布及抗氧化能力差異
采用差速離心法對高、低累積菜心品種中PAEs的亞細胞分布情況進行比較分析表明,兩種菜心PAEs均主要分布于細胞壁,但低累積菜心品種根部細胞壁的PAEs含量明顯高于地上部細胞壁中含量,而對于高累積菜心品種這種差異不明顯,這可能是低累積菜心品種具有更低轉(zhuǎn)運系數(shù)的內(nèi)在機制,即低累積菜心根部細胞壁能夠滯留更多的PAEs,從而減少PAEs向地上部轉(zhuǎn)
6、運。因此,PAEs亞細胞分布差異可能是導致兩種菜心地上部PAEs累積差異形成的一個關鍵因素。另外,通過測定兩種菜心不同組織的抗氧化酶活性(包括 POD、PPO、SOD、CAT和GST)及丙二醛含量,比較不同PAEs污染水平下其抗氧化能力,結(jié)果顯示高累積菜心品種的地上部及根組織的抗氧化脅迫能力更強,說明抗氧化系統(tǒng)在菜心響應PAEs累積和脅迫中發(fā)揮重要作用。
(3)高、低累積菜心品種葉肉細胞超微結(jié)構(gòu)與光合作用差異
采用土
7、壤盆栽試驗,研究了兩種菜心在不同DBP污染水平下的生物量、葉肉細胞超微結(jié)構(gòu)和光合作用等生理特征,結(jié)果表明兩種菜心在這些生理生化特征差異明顯。與對照相比,在低污染水平下兩種菜心葉肉細胞超微結(jié)構(gòu)變化不大,但是在高污染水平下,兩種菜心葉肉細胞超微結(jié)構(gòu)變化明顯。特別是低累積菜心葉肉細胞毒害特征更明顯,如大部分葉綠體不完整或解體,淀粉粒大量減少,嗜鋨顆粒大量累積等,而高累積菜心盡管許多葉綠體腫脹明顯,但仍能保持其完整性,且細胞質(zhì)區(qū)隔化程度更高。這
8、說明菜心高累積品種比低累積品種葉肉細胞對高濃度DBP累積具有更高的耐受性。在光合作用方面,在低污染水平下兩種菜心的光合受損程度不大,低累積菜心反而在某些指標中出現(xiàn)激效反應(Hormetic response);而在高污染水平下,相比于高累積菜心品種,低累積菜心的葉綠素含量、碳同化能力、氣體交換參數(shù)、光合作用效率、光合電子轉(zhuǎn)移能力等下降更為明顯,光合系統(tǒng)受損程度更為嚴重。因此,相比于高累積菜心品種,低累積菜心由于葉肉細胞對DBP毒害耐受能
9、力更低,通過改變自身相關的組織結(jié)構(gòu)和生理機制,以減少莖葉對有害物質(zhì)的吸收、轉(zhuǎn)運和累積以免遭毒害,屬于“避性”抗污染脅迫機制,而高累積菜心莖葉具有較高抗脅迫能力,植株體內(nèi)能夠耐受較高濃度的PAEs累積,屬于“耐性”抗污染脅迫機制。
(4)菜心累積DBP高低差異的轉(zhuǎn)錄組學分析
運用 RNA-seq技術對高、低累積菜心品種在 DBP污染脅迫下的葉片轉(zhuǎn)錄組進行高通量測序,采用無參轉(zhuǎn)錄組拼接獲得Unigene序列作為參考基因組
10、,進行基因定量和差異表達分析。四組菜心樣品測序共獲得28.67Gb數(shù)據(jù),140,566條Unigene。對這些Unigene進行生物信息學注釋,共獲得110,642條Unigene的注釋信息(占總數(shù)的78.71%)。進行基于合并組裝Unigene庫的基因結(jié)構(gòu)分析,共鑒定SSR標記32,208個。通過比較兩種菜心在DBP脅迫前后篩選獲得的差異表達基因,分別進行GO功能注釋和Pathway富集分析,獲得了與抗DBP脅迫相關的功能注釋信息,如
11、防御機制、信號轉(zhuǎn)導機制、光合作用過程、氧化還原過程、抗病途徑和抗性相關轉(zhuǎn)錄因子等。Pathway聚集分析顯示,差異表達基因參與了細胞壁防御途徑、抗氧化途徑、核糖體途徑、植物激素信號傳導途徑、苯丙烷代謝途徑和丙氨酸代謝途徑等抗脅迫相關代謝途徑。其中,高累積菜心品種的抗DBP脅迫代謝途徑遠多于低累積菜心,說明其對DBP脅迫在轉(zhuǎn)錄組水平表現(xiàn)出更高的應激能力,這與前面所述高累積菜心具有更高耐受性的研究結(jié)果一致。另外,高累積菜心品種對DBP脅迫表
12、達更多的響應基因,其中上調(diào)基因數(shù)明顯多于低累積菜心,說明這兩種菜心在響應DBP脅迫過程中基因表達模式存在顯著差異。通過比較兩種菜心響應DBP脅迫的基因表達差異,在低累積菜心中篩選獲得可能與DBP脅迫相關的上調(diào)基因15個,下調(diào)基因35個;在高累積菜心中篩選獲得可能與DBP脅迫相關的上調(diào)基因28個,下調(diào)基因14個。其中,對于在兩種不同基因型菜心中均有表達,但上/下調(diào)水平相反的基因,可能是決定不同基因型菜心高/低累積DBP性狀形成密切相關的關
13、鍵基因,可以作為在分子水平研究不同基因型菜心高/低累積DBP形成機制的首要候選基因,包括幾丁質(zhì)酶、非特異性轉(zhuǎn)脂蛋白、金屬硫蛋白、木葡聚糖內(nèi)糖基轉(zhuǎn)移酶/水解酶蛋白、DREB轉(zhuǎn)錄因子和過氧化物酶體(S)-2-羥基酸氧化酶基因等。
?。?)菜心累積DBP高低差異的蛋白組學分析
在轉(zhuǎn)錄組學分析的基礎上,采用 iTRAQ技術對高、低累積品種菜心在 DBP污染脅迫下的葉片差異蛋白組進行研究,并對差異蛋白進行 GO功能注釋和Path
14、way富集分析,最后將差異蛋白與轉(zhuǎn)錄組學研究中的差異基因進行關聯(lián)分析,以篩選獲得決定菜心高/低累積DBP性狀形成的關鍵蛋白。共鑒定蛋白總序列為5,692個,其中高累積菜心中篩選獲得與DBP脅迫響應相關的差異表達蛋白上調(diào)76個、下調(diào)40個,低累積菜心中上調(diào)32個、下調(diào)47個。GO分析結(jié)果表明,低累積菜心品種LB的差異蛋白主要富集在基礎生物學過程和逆境脅迫響應過程方面,而高累積菜心品種HG中差異蛋白主要富集抗脅迫反應、細胞結(jié)構(gòu)變化及損傷修復
15、等方面。Pathway富集分析表明,低累積菜心中差異蛋白顯著富集于碳代謝、光合作用、核糖體、丙酮酸代謝和TCA循環(huán)等,高累積菜心中差異蛋白顯著富集于吞噬體、苯丙氨酸代謝、苯丙烷生物合成、苯環(huán)化合物降解和過氧化物酶等。由此可見,DBP脅迫對低累積菜心的基礎生物學過程影響較大,而高累積菜心體內(nèi)富集更多的代謝途徑直接或間接參與植株的抗脅迫反應,這也從蛋白水平說明了高累積菜心品種比低累積菜心具有更高的DBP毒害耐受性。關聯(lián)性分析結(jié)果顯示,兩種菜
16、心的轉(zhuǎn)錄組與蛋白組信息關聯(lián)性不高,相關性僅為0.3左右。進一步篩選與轉(zhuǎn)錄組關聯(lián)性較強的差異蛋白,共篩選獲得33個,其中低累積菜心品種為14個(上調(diào)6個,下調(diào)8個),高累積菜心品種為19(上調(diào)16個,下調(diào)3個)??梢?,高累積菜心品種中上調(diào)的關聯(lián)蛋白更多,且多數(shù)與植物抗逆性密切相關,如 SOD、過氧化物酶、熱激蛋白、苯丙氨酸解氨酶、幾丁質(zhì)酶、細胞色素 P450、谷胱甘肽過氧化物酶和丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶等,說明高累積菜心品種具有更多的抗DBP脅迫蛋白
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