放流個(gè)體遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)與分子判別——以黑棘鯛和紅鰭笛鯛為例.pdf

1、由于捕撈壓力和環(huán)境污染的愈加嚴(yán)重，我國(guó)漁業(yè)資源普遍衰退。20世紀(jì)50年代末，我國(guó)開(kāi)始啟動(dòng)增殖放流以達(dá)到恢復(fù)漁業(yè)資源量的目的。多年實(shí)踐證明，增殖放流可直接有效地恢復(fù)漁業(yè)資源量。但從某種意義上講，我國(guó)增殖放流的快速發(fā)展是建立在擴(kuò)大規(guī)模的粗放式基礎(chǔ)上，很大程度上缺乏科學(xué)指導(dǎo)。較為突出的兩個(gè)問(wèn)題是放流苗種遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)方法缺失和放流個(gè)體準(zhǔn)確識(shí)別困難。本研究以南海區(qū)重要的增殖放流品種——黑棘鯛（Acanthopagrus schlegelii）和紅

2、鰭笛鯛（Lutjanus erythopterus）為例，開(kāi)發(fā)微衛(wèi)星分子標(biāo)記并精選組成“分子標(biāo)記組”；從遺傳分歧度、遺傳多樣性水平、近交程度、遺傳信息保持能力四方面對(duì)比了放流苗種與自然群體，對(duì)苗種的遺傳質(zhì)量進(jìn)行了分析；使用親緣分析技術(shù)，建立了黑棘鯛放流個(gè)體分子判別方法，并在放流實(shí)踐中對(duì)方法進(jìn)行了應(yīng)用。
　　本研究分三個(gè)部分，一是黑棘鯛和紅鰭笛鯛“分子標(biāo)記組”的建立；二是黑棘鯛和紅鰭笛鯛放流苗種群體遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)方法的建立；三是黑棘鯛

3、放流個(gè)體分子判別方法的建立和應(yīng)用。
　?。ㄒ唬┓肿訕?biāo)記組的建立
　　使用“高通量測(cè)序法”共獲得黑棘鯛微衛(wèi)星序列9125條，設(shè)計(jì) PCR引物180對(duì)。使用一個(gè)黑棘鯛野生群體（N=48）對(duì)引物進(jìn)行篩選，最終獲黑棘鯛微衛(wèi)星標(biāo)記46個(gè)。根據(jù)遺傳學(xué)屬性從上述46個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記中精選出13個(gè)標(biāo)記，組成“分子標(biāo)記組”。此標(biāo)記組等位基因數(shù)（A）均值為9.31，表觀雜合度（HO）均值為0.732，期望雜合度（HE）均值為0.747，全部符合“哈

4、迪-溫伯格”平衡預(yù)期，各標(biāo)記間無(wú)連鎖不平衡現(xiàn)象。
　　從前期開(kāi)發(fā)的紅鰭笛鯛微衛(wèi)星標(biāo)記中精選出11個(gè)標(biāo)記，組成“分子標(biāo)記組”。此標(biāo)記組A均值為8，HO均值為0.746，HE均值為0.789，全部符合“哈迪-溫伯格”平衡預(yù)期，各位點(diǎn)之間不存在連鎖不平衡現(xiàn)象。
　　上述結(jié)果表明，兩個(gè)標(biāo)記組均表現(xiàn)出高度多態(tài)性，能夠?yàn)槊绶N遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)和放流個(gè)體識(shí)別提供充足的遺傳統(tǒng)計(jì)力。
　?。ǘ┓帕髅绶N遺傳質(zhì)量監(jiān)測(cè)方法的建立
　　分別使

5、用黑棘鯛、紅鰭笛鯛“分子標(biāo)記組”對(duì)兩物種的自然群體與苗種群體進(jìn)行等位基因分型，從遺傳分歧度、遺傳多樣性水平、近交程度、遺傳信息保持能力四方面對(duì)比了放流苗種與自然群體，對(duì)苗種群體的遺傳質(zhì)量進(jìn)行了分析。結(jié)果，黑棘鯛和紅鰭笛鯛苗種群體和自然群體間均存在微弱遺傳分歧（黑棘鯛FST=0.0247，紅鰭笛鯛FST=0.0161）；黑棘鯛和紅鰭笛鯛放流苗種群體的遺傳多樣性水平和有效種群大小皆低于自然群體，其近交系數(shù)（F）均值與FIS均大于自然群體。<

6、br>　　綜上，本研究采集的黑棘鯛和紅鰭笛鯛苗種的遺傳素質(zhì)皆低于自然群體，不滿足增殖放流要求。有效種群大小偏差率（黑棘鯛偏差率-77.85％，紅鰭笛鯛偏差率-35.34%）最高，是黑棘鯛和紅鰭笛鯛苗種最突出的遺傳質(zhì)量缺陷。
　?。ㄈ┓帕鱾€(gè)體分子判別方法的建立與應(yīng)用
　　使用“分子標(biāo)記組”對(duì)102尾黑棘鯛親本進(jìn)行等位基因分型，將分型數(shù)據(jù)輸入Cervus軟件進(jìn)行模擬識(shí)別，證明此標(biāo)記組具有充足的判別能力，確定LOD決斷值為5.4