醫(yī)學信息檢索與利用課件

1、醫(yī)學信息檢索與利用總 論,中山大學醫(yī)學文獻檢索教研室羅淑蓮,一、學習醫(yī)學信息檢索課的目的和意義,（一） 提高信息素質(zhì)與信息檢索 （二） 科技創(chuàng)新與信息檢索,（一）信息素質(zhì)教育與信息檢索,信息素質(zhì)(Information Literacy) 人們在工作中運用信息、學習信息技術、利用信息解決問題的能力。,,信息素質(zhì)的構成要素： （1）信息意識 （2）信息能力 信息檢索力:指熟悉各種

2、信息源，掌握信息檢索的基礎理論和基本技術，熟練地利用各種手工檢索工具和計算機檢索系統(tǒng)查找所需信息的能力 （3）信息道德,信息素質(zhì)能力的評價標準,“美國高等教育中學生信息素質(zhì)能力標準”：能確定信息資源的特點和范圍；能有效地獲取所需信息；能評價信息及其來源，利用其知識基礎和價值系統(tǒng)選擇適當?shù)男畔?；能有效利用所獲得的信息實現(xiàn)特定的目標；在信息獲取和利用時自覺遵守道德規(guī)范和有關的法律。,（二）科技創(chuàng)新與信息檢索,科技信息是知識創(chuàng)

3、新的源泉： 世界上任何一項科研成果或創(chuàng)新都是在吸取和借鑒前人或他人研究成果的基礎上，再加上自己的鉆研和創(chuàng)新所獲得的?？萍夹畔⑹强蒲械南葲Q條件。,科研選題與信息檢索 科研選題就是形成、選擇和確定所要研究和解決的課題。 科研選題是科學研究的起始步驟。它關系到科學研究的方向、目標和內(nèi)容，直接影響科研的途徑和方法，決定著科研成果的水平，價值和發(fā)展前途。,,,1、科研選題的步驟一般是： 文獻

4、調(diào)研和實際考察——提出選題——初步論證——評議和確定課題。 2、選題的過程是一個不斷反饋調(diào)整的過程，常常需要反復文獻調(diào)研和多次論證，要繼承已有的研究成果，并防止低水平重復。,,3、科研選題應遵循的基本原則 科學性原則 創(chuàng)造性原則 需要性原則 可行性原則http://kmdxb.jzcool.com/http://www.moobeye.com/http://www.szonline.net/ysj/

5、hljdxbhttp://www.dxp24.com,,（1）科學性原則： 科研選題既要尊重所依據(jù)的科學理論和科學事實，同時還要隨著基礎事實和背景理論的改變而對選擇的課題進行調(diào)整。,,（2）創(chuàng)造性原則： 概念、理論、方法、或應用上的創(chuàng)新 創(chuàng)造性原則實質(zhì)上是要求做到：在選題時熟悉別人已經(jīng)進行過的工作，避免重復勞動；課題論證時恰當估計課題的意義和可能包含創(chuàng)造性成份。,二、醫(yī)學信息檢索的基本概念,（一）

6、信息——知識——文獻信息： 對現(xiàn)實世界事物的反映。 在自然界、人類社會以及人類思維活動中普遍存在，是物質(zhì)存在方式及其運動的規(guī)律、特點的外在表現(xiàn)。知識：人們通過信息對世界的認識與掌握，是人的大腦通過思維重新組合的系統(tǒng)化信息的集合。文獻：記錄有知識的一切載體。,（二）信息檢索與文獻檢索,信息資源： 可供人類開發(fā)利用的各類信息的集合。分為非文獻信息資源和文獻信息資源兩大類。,信息檢索： 收集、組

7、織、存儲一定范疇的信息，并可供用戶按需要查詢信息的技術和過程。 信息組織的方法即信息加工、標引等（主題詞、分類…….） 信息檢索可分為三類 ： 事實型信息檢索 數(shù)據(jù)型信息檢索 文獻型信息檢索,,文獻檢索： 以某些特定的文獻信息資源為檢索對象，以獲取文獻信息為目的的信息檢索。 檢索結果是切題文獻或相關文獻的文

8、獻線索或具體的文獻。 根據(jù)檢出內(nèi)容的祥略，文獻檢索又可以分為書目檢索和全文檢索。,（三）文獻信息資源的分類,1、按文獻的出版形式分 圖書 期刊 報紙 特種文獻：科技報告、會議文獻、專利文獻、學位論文、檔案資料、產(chǎn)品資料等。,期 刊,核心期刊：刊載某學科文獻密度大、載文率、被引用率及利用率較高，深受本學科專家和讀者關注的期刊中的精華。評價期刊的常用工具： 《醫(yī)學核

9、心期刊指南》 《中文核心期刊要目總覽》 JCR（Journal Cition Report，期刊引用報告）。,,確定核心期刊和評價期刊質(zhì)量的常用方法：載文率法和引文法。IF（影響因子）= 某年內(nèi)SCI來源刊引用該刊前二年發(fā)表論文總次數(shù) / 該刊前二年發(fā)表論文篇數(shù)II（當年被引率）=某刊當年發(fā)表的論文被SCI來源刊引用的次數(shù) / 該刊當年發(fā)表論文篇數(shù),,2、按文獻的載體形式 印刷型文獻

10、 縮微型文獻 聲像資料 機讀型電子出版物 電子期刊,,電子期刊的定義： 指從投稿、編輯、出版、發(fā)行、訂購、閱讀乃至讀者意見反饋的全過程都是在網(wǎng)上進行，任何階段都不需用紙的新型出版物，稱網(wǎng)絡電子期刊。電子期刊的特點： 信息速發(fā)性高、信息量大、信息共享性強、交互性強、可讀性強、易檢索、良好的信息擴展性、內(nèi)容、形式多樣,,從網(wǎng)絡獲取電子期刊的

11、方式： 出版商、代理商、搜索引擎、其它網(wǎng)站的友好鏈接、專門收集期刊的站點,,3、按文獻的內(nèi)容加工級次 一次文獻：原始文獻 二次文獻：對一次文獻進行加工整序后衍生得到的文獻。主要是揭示和報道一次文獻，提供查找一次文獻的線索。 三次文獻：包括綜述、評論、進展等。 零次文獻：未經(jīng)發(fā)表或進入社會交流、未經(jīng)系統(tǒng)加工整理的原始文獻記

12、錄。,三、文獻信息檢索語言,文獻信息檢索語言： 根據(jù)文獻信息檢索的需要而創(chuàng)制的人工語言。 檢索語言分為描述文獻外表特征的語言和描述文獻內(nèi)容特征的檢索語言兩大類。,,描述文獻外表特征的檢索語言： 題名索引、著者索引、引文索引、序號索引等。描述文獻內(nèi)容特征的檢索語言： 分類檢索語言 主題檢索語言 代碼檢索語言：用代表事物的代

13、碼作為標識系統(tǒng)的索引語言。（化合物分子式索引、環(huán)狀化合物環(huán)系索引、化學物質(zhì)號索引等） 。,（一）分類語言及中圖法,分類語言： 一種用分類號表達文獻中的各種概念，按學科、專業(yè)對各種概念加以分類和系統(tǒng)排列的文獻信息檢索語言。 （美國國會圖書館圖書分類法、杜威十進分類法、國際十進分類法、中國圖書館分類法、國際疾病分類等） 我國文獻分類的主要依據(jù)是《中國圖書館分類法》（簡稱《中

14、圖法》）。,《中圖法》,定義： 依一定的思想觀點，以學科分類為基礎，綜合圖書資料的內(nèi)容、特點，分門別類組成的分類表。 以等級制為標記制度，依照從總——分、一般——特殊、低級——高級、簡單——復雜的邏輯次序，逐層展開各門學科知識的類目等級體系，系統(tǒng)地組織文獻。,,《中圖法》第四版將文獻知識分為5大部類，即馬、列、毛澤東思想；哲學；社會科學；自然科學；綜合性圖書。下分22個基本大類。 例如 O：數(shù)理科

15、學、化學 Q：生物科學 R：醫(yī)藥衛(wèi)生 每個類目采用拉丁字母和阿拉伯數(shù)字相結合的混合號碼,,R 醫(yī)藥、衛(wèi)生（17個二級類目） 1   預防醫(yī)學、衛(wèi)生學 2     中國醫(yī)學 3   基礎醫(yī)學 4  &

16、#160;  臨床醫(yī)學 5   內(nèi)科學 6     外科學 71 婦產(chǎn)科學 72  兒科學 73 腫瘤學 74  神經(jīng)病學與精神病學 75 皮膚病學與性病學 76  耳鼻咽喉科學

17、 77 眼科學 78  口腔科學 79 外國民族醫(yī)學 8 特種醫(yī)學 9 藥學,每個類目還可細分至六、七級類目，如 ： R6 外科學 R65 外科學各論 R655 胸部外科學 R655.1

18、胸壁 R655.2 胸膜 R656 腹部外科學 R656.1 急腹癥 R656.2 腹部疝 R656.3 腹壁 R656.31 腹壁炎癥 R656.32 腹壁損傷,

19、（二）文獻標識碼,文獻標識碼與中圖法分類號不是一回事根據(jù)《中國學術期刊檢索與評價數(shù)據(jù)規(guī)范》的規(guī)定，對文獻標識碼規(guī)定如下： A——理論與應用研究學術論文（含綜述） B——實用性技術成果報告 C——業(yè)務指導與技術管理性文章 D——一般動態(tài)性信息（通訊、報導、會議活動、專訪等） E——文件、資料,（三）主題語言,主題檢索語言：一種采

20、用描述文獻主題內(nèi)容的詞語標識并按照字順排檢文獻的檢索語言。主要包括主題詞和關鍵詞兩種。敘詞法：嚴格規(guī)范化、可進行概念組配、具有完善參照系統(tǒng)、具有范疇索引等。關鍵詞法：以出現(xiàn)在文獻的標題、摘要或全文中能表達文獻實質(zhì)內(nèi)容的詞或關鍵性專業(yè)名詞術語作為檢索標識。,1、主題語言——主題詞,主題詞： 又稱敘詞，是以規(guī)范化的詞匯來表達文獻內(nèi)容的主題。 規(guī)范化也就是對文獻中的同義詞、近義詞、多義詞等加以規(guī)范，同一主題概念的文

21、獻相對集中在一個主題詞下。采用參照系統(tǒng)間接反映主題概念之間的關系,,如：“腎功能衰竭” renal failure 或 Kidney failureMESH: renal failure see Kidney failure 采用主題詞檢索，能實現(xiàn)較高的查全率和查準率。,2、主題語言——關鍵詞,關鍵詞

22、： 非規(guī)范化（未經(jīng)嚴格規(guī)范化處理）檢索語言，屬于自然語言范疇。能夠及時反映文獻的最新信息，用法簡便。 如：Apoptosis 但對同義詞、近義詞未經(jīng)嚴格規(guī)范，因此同一主題概念的文獻標引相對分散，容易導致漏檢和誤檢。,3、醫(yī)學主題詞詞表——MeSH,Medical Subject Headings（MeSH）美國國立醫(yī)學圖書館編制的權威性主題詞表。規(guī)范化的可擴充的動態(tài)性敘詞表。匯集約18,00

23、0多個醫(yī)學主題詞。,,MeSH 附有各種參照和注釋，它是對生物醫(yī)學文獻進行標引和檢索的依據(jù)。 MeSH引入范疇表(樹形結構,Tree Structure)，將主題詞按其學科性質(zhì)、詞義范圍的上下類屬及派生關系，分別劃為15大類，其中有9類又分若干子類目，子類目下面又分若干更小的類目。18,000多個主題詞按其學科概念的性質(zhì)分別列入各自所屬的類目之下。,,GASTROIN TESTINAL NEOPLASMS胃腸腫瘤 INTEST

24、IINAL NEOPLASMS 腸腫瘤 CECAL NEOPLASMS 盲腸腫瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 闌尾腫瘤 COLONIC NEOPLASMS 結腸腫瘤 COLONIC POLYPS 結腸息肉 ... ...

25、 ... ... DUODENAL NEOPLASMS 十二指腸腫瘤 ILEAL NEOPLASMS 回腸腫瘤 ... ... ... ...,,副主題詞(Subheadings)又稱限定詞，與主題詞進

26、行組配，對某一主題詞的概念進行限定或復分，使主題詞具有更高的專指性。 如：診斷（Diagnosis，DI）、藥物治療（Drug Theray，DT）。MeSH有副主題詞92個在檢索中，主題詞與副主題詞的組配（主題詞/副主題詞）須有邏輯關系。 如：阿司匹林治療感冒 阿司匹林/治療應用；感冒/藥物療法。,四、醫(yī)學信息檢索的方法、途徑,檢索途徑 常用檢索方法檢索步驟及檢索策略 檢索效果評價指標

27、提高機檢查全率、查準率的方法,1、常用的檢索途徑,（1）主題途徑（2）著者途徑（3）代碼途徑（4）題名途徑（5）分類途徑,2、常用的檢索方法,順查法 倒查法 抽查法 追溯法,3、醫(yī)學信息檢索的一般步驟,檢索準備階段檢索實施階段,,檢索準備階段①分析課題，明確檢索目的及要求（課題所屬的學科范圍、要求的文獻類型、年限、語種、需要的文獻量等）；②選擇檢索系統(tǒng)（包括檢索工具或數(shù)據(jù)庫）；③確定檢索方法；④選擇檢索用詞及檢索

28、途徑。檢索實施階段 包括實際檢索操作，檢索策略優(yōu)化與反饋，檢索結果的篩選和整理，獲取原始文獻等。,4、檢索效果評價指標,被檢出相關文獻量查全率：R = 相關文獻總量 被檢出相關文獻量查準率：P = 被檢出文獻總量 未檢出相關文獻量漏檢率：M =

29、 相關文獻總量 被檢出非相關文獻量誤檢率：N = 被檢出文獻總量,,,,,,5、提高查全率、查準率的方法,提高查全率的方法： 用主題詞檢索； 主題詞、關鍵詞、同義詞間用or 組配； 用上位詞（擴展下位詞）檢索； 截詞檢索； 少用副主題詞組配。,,提高查準率的方法： 用主

30、題詞檢索； 用下位詞（專指度）檢索 ； 檢索詞的字段限定 ； 副主題詞組配限制 。,五、計算機檢索基礎,文獻檢索的技術手段 手工檢索：利用各種印刷型檢索工具，人工查找所需的文獻信息。 計算機檢索：根據(jù)信息特定的需求，利用計算機從相關數(shù)據(jù)庫中檢索所需要的文獻信息。 網(wǎng)絡信息檢索：通過互聯(lián)網(wǎng)上提供的網(wǎng)絡信息查詢工具，從網(wǎng)上獲取文獻信息。,,計算機檢索系

31、統(tǒng)包括文獻存儲和文獻檢索兩部分，分別對應數(shù)據(jù)庫的建立和利用。計算機檢索是目前廣大醫(yī)學臨床與科研工作者獲取醫(yī)學文獻信息最常用的方法和手段，具有信息量大、操作技能容易掌握、方便快捷等特點。,（一）數(shù)據(jù)庫基本概念,數(shù)據(jù)庫的定義： 計算機把大量的數(shù)據(jù)項有機地集中起來存放在數(shù)據(jù)文件中，構成一個存放數(shù)據(jù)的整體，即數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫文件： 各項數(shù)據(jù)以二維表格形式存放于數(shù)據(jù)文件中，一個以二維表格形式存放在

32、磁盤上的數(shù)據(jù)文件稱為數(shù)據(jù)庫文件（庫文件）。,數(shù)據(jù)庫文件示意（字段、記錄、文檔）,記錄,字段,,,,,,記錄,（二）字段、記錄、文檔,字段： 計算機檢索的最基本單位。計算機檢索的重要字段包括篇名(Title)、作者(Author)、作者地址(Address)、刊名（Source,來源）、關鍵詞(Keyword)、主題詞(MeSH)、文摘(Abstract)等。記錄： 在一個二維表格中

33、，每一欄稱為一個字段(Field)，多個字段構成的一條完整信息稱為一條記錄(Record)。,,文檔(File)：數(shù)據(jù)庫中一部分記錄的集合。文檔中的一條記錄就是一篇文獻的題錄或文摘。一個數(shù)據(jù)庫可以由一個文檔組成，也可以由多個文檔組成。,（三）計算機檢索的布爾邏輯運算符,邏輯與　 AND A AND B，要求檢出文獻中同時包含概念A和概念B，其作用是縮小檢索范圍，提高查準率。 邏輯或　OR A OR B，要求檢出文獻