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1、1分子遺傳學(xué)名詞解釋:DNA甲基化(DNAmethylation):是指由DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶介導(dǎo),催化甲基基團(tuán)從S腺苷甲硫氨酸向胞嘧啶的C5位點(diǎn)轉(zhuǎn)移的過程。ENCODE計(jì)劃(TheEncyclopediaofDNAElementsProject):即“DNA元件百科全書計(jì)劃”,簡(jiǎn)稱ENCODE計(jì)劃,是在完成人類基因組全序列測(cè)定后的2003年9月由美國(guó)國(guó)立人類基因組研究所(NationalHumanGenomeResearchInstit
2、ute,NHGRI)組織的又一個(gè)重大的國(guó)際合作計(jì)劃,其目的是解碼基因組的藍(lán)圖,鑒定人類基因組中已知的和還不知功能的多個(gè)物種的保守序列等在內(nèi)的所有功能元件。ENCODE計(jì)劃的實(shí)施分為3個(gè)階段:試點(diǎn)階段(apilotphase)、技術(shù)發(fā)展階段(atechnologydevelopmentphase)和生產(chǎn)階段(aproducttionphase)。gRNA(guideRNA):既指導(dǎo)”RNA(gRNA,guideRNA),能通過正常的堿基配
3、對(duì)途徑,或通過G—U配對(duì)方式與mRNA上的互補(bǔ)序列配對(duì),指導(dǎo)編輯的進(jìn)行。GTAG規(guī)律(GTAGrule):真核生物所有編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因,其RNA前體在內(nèi)含子和外顯子交界處有兩個(gè)較短的保守序列,內(nèi)含子的左端均為GT,右端均為AG,此規(guī)律稱GTAG規(guī)律。miRNA:即小RNA,長(zhǎng)度為22nt左右,5′端為磷酸基團(tuán)、3′端為羥基。miRNA廣泛存在于真核生物中,不具有開放閱讀框架,不編碼蛋白質(zhì),其基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是發(fā)夾狀結(jié)構(gòu),在RNaseⅢ
4、酶切后以雙鏈形式存在,是近幾年在真核生物中發(fā)現(xiàn)的一類具有調(diào)控功能的非編碼RNA,它們主要參與基因轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控。RNA編輯(RNAediting):是指通過堿基修飾、核苷酸插入或刪除以及核苷酸替換等方式改變RNA的堿基序列的轉(zhuǎn)錄后修飾方式。RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體(RNAInducedSilencingComplex,RISC):與siRNA結(jié)合后可識(shí)別并切斷mRNA。RNA指導(dǎo)的DNA甲基化(RNADirectedDNAMethyla
5、tionRDDM):活性RISC進(jìn)入核內(nèi),指導(dǎo)基因發(fā)生DNA的甲基化。密碼子擺動(dòng)假說(wobblehypothesis):密碼子的第1,2位核苷酸(5’→3’)與反密碼子的第2,3核苷酸正常配對(duì);密碼子的的第3位與反密碼子的第1位配對(duì)并不嚴(yán)謹(jǐn),當(dāng)反密碼子的第1位為U時(shí)可識(shí)別密碼子第3位的A或G,而G則可識(shí)別U或C,I(次黃嘌呤)可識(shí)別U或C或A。比較基因組學(xué)(comparativegenomics):是一門通過運(yùn)用數(shù)理理論和相應(yīng)計(jì)算機(jī)程
6、序,對(duì)不同物種的基因組進(jìn)行比較分析來研究基因組大小和基因數(shù)量、基因排列順序、編碼序列與非編碼序列的長(zhǎng)度、數(shù)量及特征以及物種進(jìn)化關(guān)系等生物學(xué)問題的學(xué)科。表觀遺傳變異(epigeicvariation):基因的堿基序列未發(fā)生改變,而是由于DNA甲基化,組蛋白的乙酰化和RNA編輯等修飾導(dǎo)致基因活性發(fā)生了變化,使基因決定的表型發(fā)生變化,且可遺傳少數(shù)世代,但這種變化是可逆的。超基因家族(supergenefamily):是DNA序列相似,但功能不
7、一定相關(guān)的若干個(gè)單拷貝基因或若干組基因家族的總稱。沉默子(silencer):一種轉(zhuǎn)錄負(fù)調(diào)控元件,當(dāng)其結(jié)合特異蛋白因子時(shí),對(duì)基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。特點(diǎn)很象增強(qiáng)子,但不增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄,而是減弱轉(zhuǎn)錄,故稱負(fù)增強(qiáng)子。代謝組學(xué)(metabolomics):是對(duì)某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時(shí)進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科。端粒(telomere):是由獨(dú)特的DNA序列及相關(guān)蛋白質(zhì)組成的線性真核染色體的末端結(jié)構(gòu),它具有防止末端基因
8、降解、染色體末端間的粘連和穩(wěn)定染色體末端及其精確復(fù)制等功能。反向遺傳學(xué)(reversegeics):是從改變某個(gè)感興趣的基因或蛋白質(zhì)入手,然后去尋找3組蛋白修飾(histonemodification):是指染色質(zhì)上的組蛋白被甲基化、乙?;蛄姿峄倪^程。中心法則(centraldogma)F.Crick于1958年提出的闡明遺傳信息傳遞方向的法則,指出遺傳信息從DNA傳遞至RNA,再傳遞至多肽。DNA與RNA之間遺傳信息的傳遞是雙向的
9、,而遺傳信息只是單向地從核酸流向蛋白質(zhì)簡(jiǎn)答題:1.核小體與核小體定位在基因表達(dá)及其調(diào)控中有何作用?2.原核生物與真核生物的啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)有什么差別?原核生物的啟動(dòng)子在操縱元中,從mRNA開始轉(zhuǎn)錄的位點(diǎn)以上都是啟動(dòng)子序列,20bp200bp特點(diǎn):1.Pribnow框:TATAAT,位于10左右,是RNA聚合酶的牢固結(jié)合位點(diǎn)2.Sextama框:TTGACA,位于35附近,是RNA聚合酶的初始結(jié)合位點(diǎn)3.上述二者及之間的距離決定轉(zhuǎn)錄效率,一般距
10、離17bp左右4.CAP位點(diǎn)cAMP受體蛋白復(fù)合物在啟動(dòng)子上的的結(jié)合位點(diǎn)真核生物啟動(dòng)子真核生物有三類RNA聚合酶,與此對(duì)應(yīng),有三類不同的啟動(dòng)子。事實(shí)上RNA聚合酶Ⅱ,Ⅲ所作用的啟動(dòng)子情況比較復(fù)雜RNA聚合酶Ⅰ識(shí)別的啟動(dòng)子,除5SrRNA基因外,其它rDNA基因組成一個(gè)大的多拷貝基因族,轉(zhuǎn)錄成一個(gè)45S的rRNA前體,其啟動(dòng)子由起始位點(diǎn)的核心啟動(dòng)子和其上游控制元件兩部分組成。核心啟動(dòng)子包括45到20,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的啟始;上游控制元件從200到
11、150,它們之間的序列長(zhǎng)度對(duì)轉(zhuǎn)錄效率影響很大。RNA聚合酶Ⅲ啟動(dòng)子可分為兩種類型。一種是啟動(dòng)子位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)下游,又稱下游啟動(dòng)子(downstreampromoter)、基因內(nèi)啟動(dòng)子(intrageicpromoter)或內(nèi)部控制區(qū)(internalcontrolregion)。另一種啟動(dòng)子是與常見的啟動(dòng)子相似,又稱上游啟動(dòng)子(upstreampromoter)。下游啟動(dòng)子又分為兩個(gè)亞型,Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型內(nèi)部啟動(dòng)子有兩個(gè)分開的序列box
12、A(TGGCNNAGTGG)(共同序列RRYNNARYGG),和boxC(CGGTCGANNCC)(共同序列RRTGGGATGACC),而它們之間的距離比較固定,為中間元件(internalelementIE),這是5SrRNA基因的典型結(jié)構(gòu)。Ⅱ型內(nèi)部啟動(dòng)子由boxA和boxB(GGTTCGANTCC)組成,兩者之間距離較大,且不固定,是tRNA基因啟動(dòng)子的典型結(jié)構(gòu)。上游啟動(dòng)子包括三部分元件,即TATA框,近側(cè)序列元件(proximal
13、sequenceelementPSE),和遠(yuǎn)側(cè)序列元件(distalsequenceelementDSE),這是部分snRNA基因啟動(dòng)子的典型結(jié)構(gòu)。RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子由四部分元件組成,即轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、TATA盒、上游元件和遠(yuǎn)上游元件。轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)(initiats)在有些Ⅱ型轉(zhuǎn)錄酶啟動(dòng)子中比較保守,其一致性序列為PyPyANTAPyPy,轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)常和TATA盒組成核心啟動(dòng)子起始基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄,但與其相連的上游元件和增強(qiáng)子可以促進(jìn)其高效轉(zhuǎn)錄。對(duì)
14、于含TATA盒的啟動(dòng)子,其啟始點(diǎn)常在其下游25bp—30bp,有的基因啟動(dòng)子無典型起始子序列,則RNA聚合酶根據(jù)TATA盒下游30bp附近的第一個(gè)嘌呤堿基作為轉(zhuǎn)錄啟始點(diǎn)絕大多數(shù)Ⅱ型轉(zhuǎn)錄酶啟動(dòng)子均含有TATA盒,一致性序列為TATAAAA,第5和7位A有時(shí)可被T取代,看家基因(housekeepinggenes)、同源異形基因(homoboxgene)和哺乳類發(fā)育中的免疫控制基因無TATA盒。而奢侈基因(luxarygenes)具有TAT
15、A盒,它可能是幫助RNA聚合酶正確識(shí)別其下游的起始子,從正確的位置起始轉(zhuǎn)錄;有些啟動(dòng)子的TATA盒對(duì)轉(zhuǎn)錄十分重要,一旦缺失則完全失去活性。故TATA盒對(duì)有些Ⅱ型轉(zhuǎn)錄酶啟動(dòng)子的功能是十分重要。3.常見的反式作用因子有哪些?其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是什么?4.原核生物與真核生物基因表達(dá)調(diào)節(jié)機(jī)制的主要差別是什么?A原核生物的基因多以操縱子為單位,轉(zhuǎn)錄和翻譯是偶聯(lián)的;真核生物的基因轉(zhuǎn)錄、RNA前體的加工、剪接在細(xì)胞核中進(jìn)行,而翻譯則在細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行.在原核生物
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