RNA二級結構在果蠅Dscam外顯子簇6互斥可變剪接中的調控功能研究.pdf

1、可變剪接是多細胞真核生物中RNA轉錄后加工的一種形式，是增加蛋白質多樣性的重要途徑，在決定物種特異性及組織特異性分化方式上具有重要的作用，與許多遺傳性疾病和癌癥的發(fā)生都有著密切的關系。互斥可變剪接是可變剪接的一種類型，它只能選擇一個可變外顯子進入成熟mRNA;選擇不同的可變外顯子，會形成不同的mRNA，進而形成多種蛋白質異構體。互斥可變剪接的發(fā)生是一個復雜而又精細的調控過程，大量的剪接調控蛋白和不同的RNA二級結構都參與其中，具體的調控

2、機制多種多樣，仍有待補充和完善。
　　黑腹果蠅的Dscam基因是互斥可變剪接的經(jīng)典案例，Dscam基因與果蠅神經(jīng)系統(tǒng)的分化和先天免疫系統(tǒng)的發(fā)生密切相關，它經(jīng)過四個外顯子簇的可變剪接可以產生38016種不同的蛋白質異構體，但Dscam基因剪接的調控機制卻不是很清楚。我們實驗室已經(jīng)用實驗證明了錨定位點-選擇序列互補配對調控Dscam基因互斥可變剪接的假說，并發(fā)現(xiàn)和證實了LCR元件對Dscam基因外顯子簇6互斥可變剪接的調控機制。且Ds

3、cam基因含有四個可變外顯子簇，共計95個可變外顯子，其復雜而又精細的可變剪接調控機制仍有待繼續(xù)豐富和拓展。
　　該研究首先通過生物信息學方法在Dscam基因外顯子簇6的最后一個可變外顯子6.48與組成型外顯子7之間的內含子上發(fā)現(xiàn)兩個保守的順式元件，且它們可以反向互補配對形成二級結構，且該二級結構在11種果蠅中保守;再通過突變實驗、回復突變實驗和刪除實驗證實了該二級結構能夠正向調節(jié)Dscam基因外顯子簇6剪接的可變外顯子總體選擇比