細胞周期的分叉分析方法.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、至今為止,對細胞周期(cellcycle)方面的研究有巨大的進步。生物實驗通常只能研究局部的少數幾個基因或蛋白之間的關系。雖然用這種方法對細胞周期的研究已經取得了大量的成就,但對細胞周期這個生命活動的整體行為卻很難給出系統(tǒng)、全局的解釋。為了更清楚地了解細胞周期這個復雜的生命現象,近20年來逐漸地建立起來了一套通過整合細胞周期實驗數據、建立數學模型、然后再進行數據處理和理論分析的方法?,F在這套分析方法已經在醫(yī)學的前沿領域和其他的領域研究中

2、被廣泛應用。
   在細胞周期的實驗中,有兩個重要問題引起我們的關注:
   (1)什么造成了細胞中周期蛋白的振蕩性態(tài)?
   (2)什么因素影響細胞周期的振蕩強度和頻率?
   為了理解上面兩個問題。我們的做法如下:
   第一步:整合前輩們(主要是有關細胞周期的實驗數據,和他們建立的數學模型);
   第二步:數值模擬數學模型并獲得相關數據、分析細胞中關鍵蛋白的振蕩強度和頻率;

3、   第三步:在保持其調控結構和動力學特征的條件下,簡化細胞周期數學模型,并用霍普夫分叉理論探討細胞周期所涉及化合物的振蕩性態(tài);
   第四步:初步從數學角度探究細胞周期的分叉現象的機制。
   本論文得出以下主要結果:
   一、按照Ferrel建立的細胞周期模型的直觀思路,應該有:振子的頻率與周期蛋白的合成率是單調增加。但他們的模型是有缺陷,導致合成率與振子的頻率不單調:我們修正了他們的模型,實現了周期蛋白

4、的合成率與振子的頻率的單調關系。我們的修正模型更合理。
   二、我們發(fā)現,在修正的Ferrell模型中,系統(tǒng)發(fā)生兩次Hofp分叉,而振子周期就在這兩個分叉點的周期之間。
   三、我們簡化了Ferrell模型,嘗試了四維模型和二維模型。這兩種簡化的細胞周期模型仍保留了正、負反饋的調控網絡結構,仍可以出現了雙穩(wěn)和霍普夫分叉動力學現象。說明這些簡化保留了細胞周期模型的本質。
   四、利用保留本質的簡化模型,初步探

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