太平洋多金屬結(jié)核區(qū)和富鈷結(jié)殼區(qū)微生物多樣性及短桿菌屬(Brevirhabdus)多相分類學(xué)研究.pdf

1、海洋環(huán)境地形復(fù)雜、生境獨特，棲息著大量的微生物。研究海洋微生物，可增進(jìn)人類對微生物適應(yīng)海洋極端環(huán)境機(jī)制的認(rèn)識，為生命的起源進(jìn)化提供理論支持，并為生物礦化、生物活性物質(zhì)研究提供理論依據(jù)。本文針對太平洋深海多金屬結(jié)核區(qū)和富鈷結(jié)殼區(qū)結(jié)核內(nèi)部和外周沉積物微生物多樣性進(jìn)行研究，并對太平洋海隆熱液區(qū)分離獲得的一株菌株進(jìn)行多相分類學(xué)研究。
　　首先，采用可培養(yǎng)的方法分離培養(yǎng)微生物。多金屬結(jié)核區(qū)分離得到的136株菌株，可分為51個分類單元。富鈷結(jié)

2、殼區(qū)分離得到的54株菌株，可分為19個分類單元。多金屬結(jié)核區(qū)和富鈷結(jié)殼區(qū)可培養(yǎng)細(xì)菌主要類群為α和γ變形菌綱細(xì)菌。相比較而言，多金屬結(jié)核區(qū)物種豐富度指數(shù)(ACE、Chao1)和多樣性指數(shù)(Shannon)均高于富鈷結(jié)殼區(qū)。本次研究發(fā)現(xiàn)部分細(xì)菌可能參與結(jié)核結(jié)殼錳氧化過程。此外，一些菌株與已報道菌株間的序列相似性較低，通過后續(xù)多項分類學(xué)研究表明其代表了一個新屬。另外，采用非培養(yǎng)的方法構(gòu)建結(jié)核內(nèi)部及外周沉積物的16S rRNA基因文庫，獲得10

3、13條細(xì)菌序列和640條古菌序列，分析了結(jié)核內(nèi)部及外周沉積物的微生物多樣性。1013條細(xì)菌序列可分為414個不同的細(xì)菌OTU，分為15個門，8個非培養(yǎng)的系統(tǒng)發(fā)育種群和一個未鑒定種群。所有文庫的細(xì)菌主要類群是變形菌門。640條古菌16S rRNA基因序列分成31個OTU。奇古菌門是古菌中的主要類群包含21個OTU。奇古菌門主要種類是海洋古菌群Ⅰ（Marine GroupⅠ）。廣古菌門(Euryarchaeota)包含13條序列10個OTU