太平洋海水樣品中兩株細(xì)菌的多相分類研究.pdf

1、太平洋占世界海洋總面積的49.8％，是地球上面積最大、最深的大洋，孕育了數(shù)量巨大種類極為豐富的海洋微生物。這些微生物進(jìn)化出獨(dú)特的生理、代謝特征和生態(tài)功能，具有重要的研究?jī)r(jià)值和廣闊的應(yīng)用前景。對(duì)它們的分離篩選及系統(tǒng)鑒定研究，是后續(xù)深入研究的基礎(chǔ)。本文以分離自太平洋海水樣品的兩株細(xì)菌為研究對(duì)象，利用多相分類方法研究分析了兩株菌細(xì)胞形態(tài)、生長(zhǎng)條件、生理生化性質(zhì)、細(xì)胞脂肪酸組成、主要極性脂組分、分子遺傳學(xué)等多方面的特征，最終確立了兩株細(xì)菌的分類

2、地位。
　　 1、菌株P(guān)-50-3的多相分類研究
　　 菌株P(guān)-50-3分離于采自太平洋CTD04站點(diǎn)50m深的海水樣品。菌株P(guān)-50-3的革蘭氏染色反應(yīng)為陰性，細(xì)胞呈桿狀。其生長(zhǎng)溫度范圍為10-40℃，最適生長(zhǎng)溫度為30℃;生長(zhǎng)鹽度范圍為0-12％NaCl(w/v)，最適生長(zhǎng)鹽度為2.0％NaCl;生長(zhǎng)的pH范圍為6.0-9.5，最適生長(zhǎng)的pH值為7.5。菌株P(guān)-50-3能夠還原硝酸鹽為亞硝酸鹽，其細(xì)胞氧化酶和觸酶反應(yīng)

3、為陽性。該菌株不能降解酪蛋白、明膠、彈性蛋白、淀粉、Tween80和七葉苷。
　　 菌株P(guān)-50-3的主要脂肪酸為C18∶1ω7c、C18∶0、11-methylC18∶1ω7c和C16∶0。該菌主要呼吸醌均為Q-10，主要極性脂類為磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol，PG)、磷脂酰膽堿(phosphatidylcholine，PC)、兩種未鑒定結(jié)構(gòu)的含氨基脂類和一種未鑒定結(jié)構(gòu)的極性脂類。菌株P(guān)-50-3基因組

4、DNA的G+C含量為69.0mol％。
　　 16SrRNA基因序列分析表明菌株P(guān)-50-3與AlbimonasdonghaensisDS2T具有最高的序列相似性(95％)，基于16SrRNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹中，菌株P(guān)-50-3與菌株AlbimonasdonghaensisDS2T聚集成簇，在Rhodobacteraceae科形成獨(dú)立的進(jìn)化分支。
　　 基于以上多相分類學(xué)數(shù)據(jù)，菌株P(guān)-50-3應(yīng)代表Albimon

5、as屬的一個(gè)新種，命名為Albimonaspacificasp.nov.，菌株P(guān)-50-3(=KATC16527r=CGMCC1.11030T)為該新種的模式菌株。
　　 2、菌株P(guān)-1km-3的多相分類研究
　　 菌株P(guān)-1km-3分離于采自太平洋CTD04站點(diǎn)1000m深的海水樣品。菌株P(guān)-1km-3細(xì)胞為革蘭氏陰性，桿狀，其形態(tài)具有雙態(tài)特征:一類細(xì)胞具有一根極生鞭毛，可游動(dòng);另一類細(xì)胞端部則具有一根菌柄，無法游動(dòng)。

6、細(xì)胞約1.0-3.0μm長(zhǎng)，0.3-0.5μm寬。菌株P(guān)-1km-3嚴(yán)格好氧。菌株的生長(zhǎng)溫度范圍為6-40℃，最適生長(zhǎng)溫度為30℃;生長(zhǎng)鹽度范圍為0.5-12％NaCl(w/v)，最適生長(zhǎng)鹽度為2.0％NaCl;生長(zhǎng)所要求的pH范圍為6.0-9.5，最適pH值為7.0。
　　 菌株P(guān)-1km-3的主要脂肪酸為C18∶1ω7c、C18∶0、11-methylC18∶1ω7c、C17∶0和C19∶0cycloω8c。菌株P(guān)-1km-

7、3含有的極性脂主要有單半乳糖甘油二酯(monoglycosyldiglyceride，MGDG)、吡喃葡萄糖醛酸甘油二酯(glucuronopyranosyldiglyceride，GUDG)、硫代異鼠李糖甘油二酯(sulfoquinovosyldiacylglycerol，SQDG)和磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol，PG)。菌株P(guān)-1km-3基因組DNA的G+C含量為66.0mol％。
　　 16SrRN

8、A基因序列分析表明菌株P(guān)-1km-3隸屬Hyphomonadaceae科，但與科內(nèi)相近種的序列相似度均低于94％:Oceanicaulisalexandrii(93.5％)、Maricaulisparjimensis(93.2％)、Woodsholeamaritime(93.0％)?；?6SrRNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹中，菌株P(guān)-1km-3形成獨(dú)立于Hyphomonadaceae科內(nèi)其他屬的進(jìn)化分支。
　　 以上多相分類學(xué)