基于葉綠體DNA(cpDNA)序列變異的連香樹屬的親緣地理學研究.pdf

1、連香樹屬（Cercidiphyllum Sieb.et Zucc.）隸屬于連香樹科(CereidiphyllaceaeEngler)，為東亞孑遺被子植物，在上白堊紀和第三紀曾經(jīng)廣泛分布于北半球，在第四紀冰川期后分布區(qū)急劇縮小(Tanai，1992;Wolfe，1997;Manchester,1999)．連香樹屬具2種，連香樹（C.japonicum）分布于中國和日本；大葉連香樹（C.magnificum）分布于日本北部．對連香樹屬的親緣

2、地理學研究，有助于了解連香樹這一古老植物自第四紀冰期以來的進化歷史，也有助于解釋中國-日本間斷分布模式形成的原因．本研究采用cpDNA的4個非編碼區(qū)片段對連香樹屬的親緣地理學進行了研究，主要的研究結(jié)果如下：
　　 從25個葉綠體片段中篩選出4個適合連香樹屬分析的片段，對49個群體247個個體進行了序列分析．結(jié)果顯示cpDNApetA-psbJ,psbE-petL、rpL32-trnL、F71-R1516基因間隔區(qū)具有18個變異位

3、點，呈現(xiàn)12個單倍型．連香樹物種水平的核苷酸多態(tài)性（Pi）為1.05xl0-3，單倍型多態(tài)性(h)為0.784;大葉連香樹物種水平的核苷酸多態(tài)性（Pi）為0.15×10-3，單倍型多態(tài)性(h)為0.5，兩個種總的遺傳多樣性水平較低．AMOVA分析結(jié)果顯示連香樹和大葉連香樹遺傳變異主要存在于群體間，群體間遺傳分化（FST）分別為93.76％和56.62％，且連香樹中89.08％的遺傳變異存在于NJ（日本北部）、SJC（日本南部和中國南部）

4、，NC（中國北部）三個地理區(qū)域之間．cpDNA單倍型多樣性、地理分布、以及網(wǎng)狀支系分析(Nested Clade Analysis)表明，連香樹屬的第四紀冰期避難所在中國中西部地區(qū)（峨眉山、中部的壺瓶山及后河周邊地區(qū)）．單倍型系統(tǒng)發(fā)育與BEAST分析表明，連香樹在大約在2.484個百萬年前(myr)分化為SJC-NC（日本南部-中國）支系和NJ（日本北部）支系，兩個支系分化后各自獨立進化．SJC-NC支系在0.08myr經(jīng)歷了群體擴張事