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文檔簡介
1、DNA基因表達(dá)芯片可以高通量地同時(shí)分析基因在不同條件下的表達(dá)水平，揭示細(xì)胞內(nèi)哪些基因是表達(dá)的，哪些基因是不表達(dá)的。分析基因表達(dá)數(shù)據(jù)的關(guān)鍵一步是尋找具有相似表達(dá)模式的基因組。如果兩個(gè)基因的表達(dá)模式是相似的，則它們或者是執(zhí)行相似的功能，或者參與同一個(gè)生物學(xué)進(jìn)程。因而，如果一個(gè)新測序基因的表達(dá)模式與一個(gè)已知的表達(dá)模式相似，那么生物學(xué)家就有理由猜測這兩個(gè)基因可能執(zhí)行相似的功能?；虮磉_(dá)分析的另一個(gè)重要應(yīng)用是揭示調(diào)控途徑，相似的表達(dá)模式通常意味著
2、協(xié)同調(diào)控。因此，分析基因表達(dá)數(shù)據(jù)的關(guān)鍵就是尋找這樣相似的“模塊”。 本論文的主要特點(diǎn)有： 1.從數(shù)學(xué)角度介紹了常用的聚類分析的優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)及相關(guān)的選擇方案。 2.對比分析了聚類分析的缺陷以及與雙聚類分析的異同點(diǎn)。 3.詳細(xì)介紹了雙聚類方法中的Cheng和Church方法以及基于模擬退火的雙聚類算法，前者為貪婪式的算法，后者為隨機(jī)智能優(yōu)化算法。 4.作者將遺傳算法和禁忌搜索算法整合應(yīng)用與基因表達(dá)數(shù)據(jù)的
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