深圳地區(qū)諾如病毒感染及其與宿主受體相互作用的分子流行病學(xué)研究.pdf

1、目的:
　　對深圳地區(qū)諾如病毒感染進(jìn)行分子流行病學(xué)研究。對水和牡蠣中諾如病毒進(jìn)行檢測，進(jìn)行暴發(fā)的溯源研究。并利用暴發(fā)研究諾如病毒感染與宿主受體組織血型抗原相互作用，預(yù)測諾如病毒的流行強度。
　　方法:
　　收集深圳地區(qū)2005-2016年腹瀉糞便樣本9580份，用GⅠ和GⅡ型諾如病毒Real-time RT-PCR、RT-PCR方法以及杯狀病毒核酸三重RT-PCR進(jìn)行檢測;通過測定基因序列，對諾如病毒進(jìn)行基因進(jìn)化分析和

2、基因分型。建立簡易的吸附-洗脫法對水體的諾如病毒進(jìn)行濃縮，還建立了牡蠣中諾如病毒的濃縮方法。另外，對諾如病毒暴發(fā)進(jìn)行組織血型抗原表型分析和HBGAs結(jié)合區(qū)分析。
　　結(jié)果:
　　(1)深圳地區(qū)散發(fā)NoV的檢出率在12.24-25.37％之間。病毒基本呈隔年增高的趨勢，每年的7-8月份達(dá)到最高峰。各年齡段NoV檢出率在12.58-21.32％。6月齡至3歲的兒童和20歲以上的成人是高危人群。
　　(2)139起腹瀉暴發(fā)疫

3、情中有122起是由諾如病毒引起。諾如病毒性腹瀉全年均可暴發(fā)，冬春季是諾如病毒暴發(fā)的高峰。深圳諾如病毒暴發(fā)主要集中在南山區(qū)，以幼兒園、學(xué)校及社區(qū)為主要場所。
　　(3)在四起水源性腹瀉暴發(fā)疫情的病人糞便中和可疑水樣中均檢出諾如病毒，NoV GⅡ.4/Den_Haag_2006b和NoV GⅡ.3各兩起，分別由于諾如病毒污染飲用水源、地下蓄水池、山泉水和二次供水所致。還四次從牡蠣中檢測出諾如病毒。
　　(4)四株諾如病毒全基因組

4、序列同源性為86.8％-99.1％，氨基酸序列的同源性為94.6-99.2％，發(fā)現(xiàn)SZ2012054毒株三個位點發(fā)生有義突變。通過Simplot重組分析，發(fā)現(xiàn)SZ2012054、SZ2012049與SZ2010422株在ORF1/ORF2重疊區(qū)發(fā)生重組。935株散發(fā)諾如病毒核苷酸序列同源性及系統(tǒng)進(jìn)化分析表明，NoV GⅠ毒株間的同源性為62.1％-100.0％，NoV GⅡ為67.4％-100.0％。43株諾如病毒屬于GⅠ，包括GⅠ.1

5、-6、GⅠ.8，共7種基因型;892株諾如病毒屬于GⅡ，分別為:GⅡ.4Sydney_2012、GⅡ.4Den_Hagg_2006b、GⅡ.4/Hunter_2004、GⅡ.4/Asia_2003、GⅡ.4/New_Orleans_2009、GⅡ.3、 GⅡ.2、GⅡ.5～7、GⅡ.12～14、GⅡ.17和GⅡ.21，共15種基因型，還有部分GⅡ.4不能進(jìn)一步分型。
　　(5)在諾如病毒暴發(fā)疫情中，GⅠ.3、GⅠ.6所致的疫情各兩

6、起，NoVGⅡ所致的疫情118起，包括10個基因亞型，分別是GⅡ.1-3、6、8、17、21GⅡ.4/Sydney_2012、GⅡ.4/DenHaag_2006b、GⅡ.4Asia2003，另有28起GⅡ疫情未能定型。2012年7月首次在散發(fā)病例中發(fā)現(xiàn)NoV GⅡ.4/Sydney_2012株，并對暴發(fā)疫情進(jìn)行了預(yù)警預(yù)測。深圳地區(qū)的NoV散發(fā)和暴發(fā)的優(yōu)勢株均為GⅡ.4Sydney_2012、GⅡ.4 Den_Hagg_2006b、GⅡ.

7、3。
　　(6)對兩起諾如病毒腹瀉暴發(fā)研究發(fā)現(xiàn)，分泌型個體對諾如病毒是易感的，且能與非分泌型唾液和抗原結(jié)合。
　　結(jié)論:
　　諾如病毒是深圳地區(qū)腹瀉散發(fā)和暴發(fā)疫情的重要病原，深圳地區(qū)每年都有一個流行的優(yōu)勢株和次優(yōu)勢株，當(dāng)新毒株的出現(xiàn)后逐步取代以往的流行株而成為新的流行株，2005-2016深圳地區(qū)優(yōu)勢株為GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.4Den_Hagg_2006b、GⅡ.3。散發(fā)病例中諾如病毒有22種基因型，