紫色土硅酸鹽細(xì)菌遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、以從四川和重慶的紫色土中分離獲得的38株硅酸鹽細(xì)菌為研究材料，采用RAPD、BOX-PCR、16SrRNAPCR-RFLP、代表菌株16SrRNA序列分析等方法研究其遺傳多樣性，確定了其系統(tǒng)發(fā)育及分類地位。 RAPD分析包括了單引物RAPD，TP-PCR。單引物RAPD在26％相似性水平上將供試菌株分5群，其中，群Ⅰ、Ⅲ和Ⅴ均由4株菌組成，群Ⅱ包括8個(gè)菌株，來(lái)源地比較雜，群Ⅳ最大，由18株硅酸鹽細(xì)菌和2株參比菌株B.mucila

2、ginosusVKPM7519T和B.mucilaginosusAS1.232組成，占供試紫色土硅酸細(xì)菌的47.3％。TP-PCR分群結(jié)果與單引物RAPD相似，在23％相似性水平上將供試菌株分為5個(gè)群，群Ⅰ和Ⅴ由5株菌組成；群Ⅱ有8株菌；群Ⅲ只有2株菌，群Ⅳ則由18株菌組成，該群菌株與標(biāo)準(zhǔn)菌株B.mucilaginosusVKPM7519T和B.mucilaginosusAS1.232聚在一起。這表明紫色土硅酸鹽細(xì)菌存在有較豐富的遺傳多

3、樣性。綜合分析結(jié)果與RAPD和TP-PCR的聚類結(jié)果相似，有17株菌和標(biāo)準(zhǔn)菌株B.mucilaginosusVKPM7519T和AS1.232同處在群Ⅰ。BOX-PCR分析中，所有供試菌株在54％的相似性水平上供試菌株與參比菌株分為了4個(gè)群，32株菌株都聚入了群Ⅱ和群Ⅲ，供試菌株中大部分還是和參比菌株親緣較近。在BOX-PCR分析中，K4單獨(dú)聚類，表現(xiàn)出比較大的特異性。所有供試菌株的16SrRNAPCR-RFLP圖譜有21種遺傳型。在6

4、2％相似性水平處，所有菌株被分為3個(gè)16SrRNA遺傳群，群Ⅰ的24株供試菌株與2株參比菌株B.mucilaginosusVKPM7519T和AS1.232聚在一起，包括12種遺傳類型譜；群Ⅱ由10株供試菌株組成，群Ⅲ包括3株菌，這兩個(gè)群的菌株與B.mucilaginosus親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。進(jìn)而，對(duì)菌株K18、K28、K38進(jìn)行了16SrDNA序列測(cè)定，供試菌株K18與B.novalis模式菌株LMG21837T同源性達(dá)到99.5％；K2