中國(guó)部分Botryosphaeriaceae真菌的系統(tǒng)發(fā)育及模式種Botryosphaeria dothidea的遺傳多樣性研究.pdf

1、葡萄座腔菌科（Botryosphaeriaceae）（子囊菌門 Ascomycota，座囊菌綱Dothideomycetes）真菌分布廣泛，種類繁多，寄主類型多樣，在我國(guó)引起多種重要的經(jīng)濟(jì)樹(shù)木枝條或主干發(fā)生潰瘍病，包括楊樹(shù)和多種果樹(shù)等。長(zhǎng)期以來(lái)病原真菌的命名多根據(jù)病害和寄主來(lái)命名，造成了同菌異名、同名異菌的問(wèn)題，引起了該科真菌的命名和分類混亂的問(wèn)題。該屬模式種Botryosphaeria dothidea是該科最常見(jiàn)的種之一，是引起樹(shù)木

2、潰瘍病最重要的病原，在我國(guó)多個(gè)氣候區(qū)均有發(fā)生，闡明該種不同地理群體間的遺傳多樣性和遺傳分化，對(duì)病害的檢測(cè)和防治具有重要意義。
　　為了澄清我國(guó)樹(shù)木潰瘍病病原真菌的種類和調(diào)查葡萄座腔菌科真菌在我國(guó)分布的多樣性，針對(duì)引起楊樹(shù)和薔薇科果樹(shù)病害的葡萄座腔菌科病原進(jìn)行研究，采用形態(tài)學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育學(xué)的方法，從我國(guó)南北方的5個(gè)典型氣候區(qū)分離到58株寄主為楊樹(shù)和37株寄主為薔薇科果樹(shù)的試驗(yàn)菌株，結(jié)合形態(tài)學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育分析方法，鑒定葡萄座腔菌科5個(gè)屬8

3、（或9）種真菌。Botryosphaeria dothidea種群具有中度偏高的遺傳多樣性，Nei’s基因多樣性指數(shù)（H）為0.6777。
　　利用形態(tài)學(xué)結(jié)合ITS、β-tubulin和EF1-α序列比較分析表明，發(fā)生于楊樹(shù)上的種類包括Botryosphaeria dothidea、Neofusicoccum parvum、Diplodia seriata、D. mutila、Dothiorella viticola和一個(gè)未定名新

4、種Fusicoccum sp.1，其中，共有53株為B. dothidea，其它種各1株；發(fā)生于薔薇科果樹(shù)上的有B. dothidea、Lasiodiplodia pseudotheobromae、Neof. parvum/Neof. ribis復(fù)合種和另一個(gè)未定名新種Fusicoccum sp.2，其中，B. dothidea15株，L. pseudotheobromae和Neof. parvum/Neof. ribis各有3株，F(xiàn)u

5、sicoccumsp.2有6株。上述種類中，D. seriata在我國(guó)是第一次報(bào)道發(fā)生在楊樹(shù)上；Do. viticola是第一次報(bào)道于滇青岡。根據(jù)β-tubulin序列系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究，對(duì)B. rhodina與其無(wú)性型L. theobromae的對(duì)應(yīng)關(guān)系提出質(zhì)疑，認(rèn)為B. rhodina的無(wú)性型應(yīng)為L(zhǎng). pseudotheobromae。研究表明，除了L. pseudotheobromae只發(fā)生于南亞熱帶外，其余絕大多數(shù)試驗(yàn)菌株在我國(guó)的

6、分布與氣候區(qū)沒(méi)有直接的聯(lián)系。
　　培養(yǎng)特征的比較和 LSU序列、ITS/EF1-α序列聯(lián)合建立的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)一步支持了兩個(gè)未定名種 Fusicoccum sp.1和 Fusicoccum sp.2的系統(tǒng)地位，屬于 Botryosphaeria complex。Fusicoccum sp.1與Fusicoccum fabicercianum表現(xiàn)出最近的親緣關(guān)系，F(xiàn)usicoccum sp.1和Fusicoccum sp.2與Bot

7、ryosphaeria complex其它種存在著顯著的培養(yǎng)特征上的區(qū)別：它們的菌落均呈現(xiàn)環(huán)狀，且培養(yǎng)至第10天氣生菌絲仍未變灰。
　　Botryosphaeria dothidea為兩類寄主上的優(yōu)勢(shì)種類，其分布區(qū)域橫跨南亞熱帶到中溫帶，顯示出對(duì)不同地理和寄主的適應(yīng)性。為了分析B. dothidea種群的遺傳分化和遺傳多樣性，從文獻(xiàn)記載的標(biāo)記中篩選出來(lái)10個(gè)簡(jiǎn)單序列重要（SSR）標(biāo)記用于分析來(lái)自5個(gè)地區(qū)種群77個(gè)試驗(yàn)菌株的遺傳多樣

8、性和種群遺傳結(jié)構(gòu)，分別來(lái)自5個(gè)氣候區(qū)：中溫帶亞濕潤(rùn)型氣候大區(qū)、暖溫帶亞濕潤(rùn)型氣候大區(qū)、北亞熱帶濕潤(rùn)型氣候大區(qū)、中亞熱帶濕潤(rùn)型氣候大區(qū)和南亞熱帶濕潤(rùn)型氣候大區(qū)。結(jié)果表明各種群的多樣性指數(shù)均為中度偏高（H=0.6777）；群體間的遺傳分化程度較低（平均Fst=0.0758），且遺傳差異大多來(lái)自群體內(nèi)部，而群體間的遺傳差異較小。除中溫帶亞濕潤(rùn)型氣候大區(qū)種群外，其余4個(gè)種群都有自己特定的等位基因，其特有等位基因數(shù)依次為21、2、2、3個(gè)。77個(gè)

9、試驗(yàn)菌株構(gòu)成的不同地理群體間的分化程度低，基因流動(dòng)較大，可能與菌株來(lái)源于人為活動(dòng)頻繁的地區(qū)有關(guān)，并且與寄主的反復(fù)遷移有直接關(guān)系，尤其是楊樹(shù)。楊樹(shù)和薔薇科寄主的菌株沒(méi)有表現(xiàn)也寄主分化特征。但同時(shí)也發(fā)現(xiàn)了不同種群特定的等位基因，包括北亞熱帶濕潤(rùn)型氣候大區(qū)種群的407bp和425bp，中亞熱帶濕潤(rùn)型氣候大區(qū)種群的424bp和429bp，南亞熱帶濕潤(rùn)型氣候大區(qū)種群的234bp、408bp和416bp及暖溫帶亞濕潤(rùn)型氣候大區(qū)種群的特定等位基因31