基于功率譜分析的蛋白編碼區(qū)預測方法的研究.pdf

1、基因識別是生物信息學的一個重要分支，隨著計算機科技的飛速發(fā)展，將其應(yīng)用到基因識別中有很重要的現(xiàn)實意義。論文中首先闡述了基因識別的重要性、主要研究方法及目前國內(nèi)外的研究現(xiàn)狀，在深入分析和比較幾種經(jīng)典的功率譜估計方法的特點和各自的優(yōu)缺點后，著重研究了基于AR模型預測DNA序列蛋白編碼區(qū)的問題。介紹了運用AR模型進行譜估計的方法以及基于AR模型的蛋白編碼區(qū)估計的技術(shù)和方法；分析了有關(guān)參數(shù)對編碼區(qū)預測準確性的影響。運用仿真軟件MATLAB建立了

2、仿真系統(tǒng)，并用計算機仿真實驗驗證了有關(guān)算法并獲得了相關(guān)結(jié)論。
　　之后，我們還研究了基于FFT預測蛋白編碼區(qū)方法的FPGA實現(xiàn)工作，為以后研發(fā)便攜式的蛋白編碼區(qū)預測儀做了一些有益的嘗試。我們首先簡單介紹了目前硬件開發(fā)工作的流程，主要FPGA芯片提供商Xilinx公司的Spartan-3的內(nèi)部結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)資源情況，然后，重點研究了基于FPGA的預測DNA序列蛋白編碼區(qū)的實現(xiàn)方法，詳細闡述應(yīng)用ISE開發(fā)平臺、Modelsim仿真工具、S