蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法研究.pdf

1、隨著人類基因組計(jì)劃的完成,人們已經(jīng)獲得了大量生物的遺傳信息,數(shù)以萬計(jì)的蛋白質(zhì)序列也已經(jīng)被測出,到2004年4月13日為止SWISS-PROT數(shù)據(jù)庫中總共收集了148516條已被測序的蛋白質(zhì)序列.然而一條蛋白質(zhì)序列必須折疊成一定的空間結(jié)構(gòu)時才能發(fā)揮它特定的生物功能,人們在對蛋白質(zhì)序列測序完成之后更希望的是得到這些蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu),以便發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)與功能之間的聯(lián)系.因此,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的研究就成為了后基因組時代生命科學(xué)領(lǐng)域人們研究的主要任務(wù)和

2、目的.目前,通過實(shí)驗(yàn)的方法獲得的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)序列只有兩萬多條(2004年4月20日,PDB數(shù)據(jù)庫中共收集了25176條),遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于蛋白質(zhì)序列的測序速度,因此理論預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)勢在必行.然而,直接從蛋白質(zhì)一級序列預(yù)測其三維空間結(jié)構(gòu)時人們又遇到了諸多困難.在對蛋白質(zhì)分子的仔細(xì)研究和分析后發(fā)現(xiàn)由二級結(jié)構(gòu)組裝而成的空間結(jié)構(gòu)是有限的.因此,如果能從蛋白質(zhì)一級序列先預(yù)測出二級結(jié)構(gòu),再由二級結(jié)構(gòu)預(yù)測三級結(jié)構(gòu)便成為一條有效的途徑.這里,蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)