預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分類(lèi)的新方法.pdf

1、生物信息學(xué)的主要任務(wù)是從急劇增加的生物序列數(shù)據(jù)中提取新的知識(shí)。蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)是生物序列數(shù)據(jù)庫(kù)的重要組成部分。目前從直接測(cè)得或者從DNA序列翻譯出來(lái)的蛋白質(zhì)序列數(shù)量急劇增長(zhǎng)，蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中已知一級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)數(shù)量已經(jīng)大大超過(guò)了已經(jīng)測(cè)定空間三維結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)數(shù)量，所以目前希望完全依靠實(shí)驗(yàn)手段來(lái)逐一確定它們的空間結(jié)構(gòu)的想法是不現(xiàn)實(shí)的，無(wú)論是來(lái)自資金方面的還是時(shí)間方面的限制都不能讓生物學(xué)家完成這一工作。 與DNA序列不同，蛋白質(zhì)是生命的具

2、體表現(xiàn)形式。蛋白質(zhì)所處的環(huán)境比DNA序列復(fù)雜得多，它的一級(jí)結(jié)構(gòu)即氨基酸序列的排列順序并不能完全確定其本身的生物和化學(xué)特性，二級(jí)結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)在蛋白質(zhì)活動(dòng)過(guò)程中同樣起到了相當(dāng)關(guān)鍵的作用。所以如何通過(guò)已知的蛋白質(zhì)一級(jí)序列的信息，快速地得到其二級(jí)結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)的相關(guān)信息，已經(jīng)成了人們研究的重要方向。 本文構(gòu)造了一種新的方法預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的類(lèi)型，屬于α、β還是αβ類(lèi)型。該方法使用了BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，通過(guò)一種新型的描述蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的向