動靜態(tài)基因調控網(wǎng)絡構建方法研究與分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、挖掘基因之間的相互作用以及基因對于外界環(huán)境變化的響應機制,可以幫助人們更好地認識生命現(xiàn)象,揭示生命本質。
  本文主要針對動靜態(tài)基因調控網(wǎng)絡的構建方法進行研究。動態(tài)網(wǎng)絡的研究能夠幫助人們深入把握系統(tǒng)的動態(tài)特征,了解基因之間的相互作用機制以及基因對于細胞或組織功能進行調控的機理。本文提出了一種基于多源信息融合的狀態(tài)空間模型(Multi-source Information Fusion State-Space Model,MIF-S

2、SM)。該模型采用變分貝葉斯(Variance Bayes)方法,有效地防止了對隱狀態(tài)維數(shù)的過高估計。在此基礎上,將轉錄因子的結合位點作為狀態(tài)空間模型參數(shù)的先驗分布,融入到基因調控網(wǎng)絡的推斷中。最后,采用T細胞活化實驗的真實數(shù)據(jù)進行實驗,通過對比加入轉錄因子結合位點信息和不加位點信息的構建狀況,證明了基于多源信息融合的狀態(tài)空間模型可以大大提高基因調控網(wǎng)絡構建的準確性。通過靜態(tài)基因網(wǎng)絡的分析,人們能夠了解到生物系統(tǒng)的結構。當前應用于基因表

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