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文檔簡介
1、目的:定植人體皮膚表面的表皮葡萄球菌( Staphylococcus epidermidis, S.epidermidis)是一種重要的院內(nèi)感染條件致病菌。當(dāng)S.epidermidis在醫(yī)療設(shè)施中形成生物被膜后,可引起慢性感染和導(dǎo)管相關(guān)性感染,難以治愈,已引起醫(yī)學(xué)界廣泛關(guān)注。研究生物被膜形成機(jī)制對其治療具有指導(dǎo)意義。雖然調(diào)控S.epidermidis生物被膜的部分分子和相關(guān)機(jī)制已被闡釋,但激發(fā)其生物被膜形成的重要分子尚不清楚。近年來,國
2、外學(xué)者研究發(fā)現(xiàn)葡萄球菌染色體 mec基因盒( Staphyloccoccal Cassette Chromosome mec, SCCmec)伴隨基因psm-mec能調(diào)節(jié)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌( Methicillin resistant Staphylococcus aureus, MRSA)生物被膜形成。在具有生物被膜形成能力的S.epidermidis標(biāo)準(zhǔn)菌株RP62A培養(yǎng)上清存在PSM-mec多肽,預(yù)實驗結(jié)果顯示攜帶 psm-
3、mec基因的耐甲氧西林表皮葡萄球菌(Methicillin resistant S. epidermidis, MRSE)具有生物被膜形成能力,提示psm-mec基因可能與MRSE生物被膜相關(guān)。但缺乏psm-mec在臨床分離S.epidermidis中表達(dá)和生物被膜形成的實驗證據(jù),psm-mec基因是否參與 MRSE生物被膜形成尚不清楚。因此,本研究旨在分析psm-mec在臨床分離S.epidermidis中的表達(dá)和特征,通過缺失突變、
4、點突變和過表達(dá) psm-mec基因,觀察突變和過表達(dá)后 S.epidermidis生物被膜形成及相關(guān)性狀的變化,探討該基因與 MRSE生物被膜形成的關(guān)系及其機(jī)制。
方法:
1分析psm-mec與臨床分離MRSE生物被膜的關(guān)系
1)攜帶psm-mec MRSE的篩選與確認(rèn):收集臨床分離S.epidermidis,通過分子生物學(xué)和微生物學(xué)方法確認(rèn)攜帶psm-mec MRSE。
2)攜帶psm-mec
5、MRSE的分子特征:多重PCR分析psm-mec攜帶株SCCmec型別的多樣性;擴(kuò)增基因間隔序列探討psm-mec與相鄰基因的連接關(guān)系;DNA序列比對分析psm-mec及其上游序列的變化;多重PCR分析攜帶psm-mec MRSE的agr型別,分析psm-mec與agr型別的關(guān)系。
3)psm-mec在MRSE中的表達(dá):提取攜帶psm-mec MRSE總RNA,采用熒光定量RT-PCR分析臨床分離MRSE psm-mec轉(zhuǎn)錄表
6、達(dá)。
4)psm-mec與MRSE生物被膜的關(guān)系:半定量生物被膜檢測法分析攜帶與未攜帶psm-mec MRSE生物被膜形成能力,探討psm-mec與MRSE生物被膜的關(guān)系。
2研究psm-mec缺失突變與MRSE生物被膜的關(guān)系
1)篩選用于構(gòu)建缺失突變的臨床菌株:運用藥敏實驗、DNA序列分析技術(shù)篩選psm-mec上下游序列與S.epidermidis標(biāo)準(zhǔn)菌株RP62A完全一致且四環(huán)素和氯霉素敏感的MRSE。
7、
2)psm-mec缺失突變株的構(gòu)建:利用融合PCR和溫度敏感性穿梭質(zhì)粒構(gòu)建同源重組質(zhì)粒pBT2-Δpsm-mec,經(jīng)鑒定后電轉(zhuǎn)金黃色葡萄球菌RN4220進(jìn)行修飾,提取質(zhì)粒后電轉(zhuǎn)用于構(gòu)建缺失突變的臨床分離MRSE,經(jīng)同源重組后篩選和鑒定psm-mec缺失突變株。
3)psm-mec缺失突變與MRSE生物被膜的關(guān)系:分析缺失突變株與野生株生物被膜形成能力的差異,驗證psm-mec與MRSE生物被膜的關(guān)系。
3
8、探討psm-mec調(diào)控MRSE生物被膜的分子機(jī)制
1)研究psm-mec是通過其RNA和/或蛋白調(diào)控生物被膜:
構(gòu)建psm-mec過表達(dá)株p221(mRNA和蛋白均表達(dá)),點突變株pM和pAG(mRNA表達(dá),蛋白不表達(dá)),分析這些菌株生物被膜形成能力,探討psm-mec是在RNA和/或蛋白水平調(diào)控S.epidermidis生物被膜。
2)分析細(xì)菌起始粘附與psm-mec誘導(dǎo)生物被膜的關(guān)系:
細(xì)菌起
9、始粘附在生物被膜形成中具有重要作用,本實驗采用染色法和平板菌落計數(shù)法檢測p221,pM和pAG菌株起始粘附能力,分析其與psm-mec誘導(dǎo)生物被膜的關(guān)系。
3)探討eDNA與psm-mec誘導(dǎo)生物被膜的關(guān)系:
胞外DNA(eDNA)在形成和穩(wěn)定生物被膜中有重要作用,DNase I可降解eDNA。本實驗首先觀察DNase I對p221,pM和pAG菌株生物被膜的影響,驗證eDNA在S.epidermidis生物被膜形成
10、中的作用。分析p221,pM和pAG菌株生物被膜中eDNA的變化,探討eDNA與psm-mec誘導(dǎo)生物被膜的關(guān)系。
過表達(dá)和激活葡萄球菌自溶酶E(autolysin E, atlE)可誘導(dǎo)細(xì)菌自溶和eDNA的釋放。本實驗分析了p221,pM和pAG菌株atlE轉(zhuǎn)錄水平,自溶酶活性,Triton X-100誘導(dǎo)的自溶,對溶葡萄球菌酶敏感性的變化,探討其在psm-mec誘導(dǎo)生物被膜中的作用。
結(jié)果:
1. ps
11、m-mec主要分布于臨床分離agr I MRSE
83.64%的臨床分離 S.epidermidis為 MRSE,其中29株攜帶psm-mec基因,攜帶率為17.58%,且僅分布于MRSE中。90%攜帶psm-mec菌株為agr I型MRSE,10%為agr陰性突變株,未見其分布于agrⅡ或Ⅲ型MRSE。提示psm-mec主要分布于agr I MRSE。
2.攜帶psm-mec MRSE的分子特征
攜帶ps
12、m-mec菌株均為class A mec,但ccr分型表現(xiàn)出明顯的多樣性。多重PCR結(jié)果顯示攜帶psm-mec菌株存在8種SCCmec型別模式,且均為混合型,但所有菌株SCCmec中均含有Ⅱ或Ⅲ型片段。psm-mec與相鄰基因 mecR1, xylR存在兩種連接模式,100%菌株的psm-mec均與mecR1相連,68.97%菌株與xylR相連。所有菌株psm-mec ORF序列無突變,4.34%菌株在psm-mec基因上游SD區(qū)存在G
13、>A的點突變。
3.攜帶psm-mec MRSE均表達(dá)此基因
Real time逆轉(zhuǎn)錄PCR結(jié)果顯示,臨床分離攜帶psm-mec MRSE均可轉(zhuǎn)錄表達(dá)psm-mec,其表達(dá)水平在103-107拷貝之間,SD區(qū)G>A點突變和野生型菌株間psm-mec表達(dá)無差異,psm-mec與相鄰基因兩種連接方式間其表達(dá)也無差異,提示psm-mec SD區(qū)G>A點突變以及與相鄰基因連接方式不影響psm-mec轉(zhuǎn)錄表達(dá)。
4.
14、 psm-mec與MRSE生物被膜相關(guān)
攜帶與未攜帶 psm-mec菌株間生物被膜形成能力差異具有統(tǒng)計學(xué)意義,提示psm-mec與MRSE生物被膜相關(guān)。SD區(qū)G>A點突變和野生型菌株間生物被膜形成能力無差異,psm-mec與相鄰基因兩種連接方式間其生物被膜形成能力也無差異,提示psm-mec SD區(qū)G>A點突變以及與相鄰基因連接方式不影響生物被膜形成。
5. psm-mec缺失突變降低MRSE生物被膜形成
15、序列比對和藥敏實驗篩選和鑒定了3株用于構(gòu)建psm-mec缺失突變的臨床分離MRSE,通過同源重組,篩選和鑒定獲得psm-mec缺失突變株。與相應(yīng)的野生株比較,3株缺失突變株生物被膜形成能力明顯降低,提示psm-mec可誘導(dǎo)MRSE生物被膜形成。
6. psm-mec mRNA調(diào)控S. epidermidis生物被膜
構(gòu)建了psm-mec過表達(dá)株和不同點突變株p221, pM和pAG,并從DNA和RNA水平得到驗證。與
16、ATCC12228比較,p221, pM和pAG菌株生物被膜形成能力明顯增加,且p221與pM,pAG菌株生物被膜形成能力差異無統(tǒng)計學(xué)意義,提示 psm-mec mRNA調(diào)控 S. epidermidis生物被膜形成。
7.eDNA在psm-mec誘導(dǎo)S. epidermidis生物被膜中起重要作用
DNase I處理明顯降低p221, pM和pAG生物被膜形成能力。與ATCC12228比較,p221, pM和pAG
17、菌株生物被膜中eDNA含量明顯增加,agr下游分子atlE mRNA表達(dá)升高,同時自溶酶活性和TritonX-100誘導(dǎo)的自溶明顯增加,這些結(jié)果提示psm-mec可能通過細(xì)菌自溶釋放eDNA誘導(dǎo)生物被膜形成。
8.psm-mec不影響S. epidermidis起始粘附和溶葡萄球菌酶敏感性
與ATCC12228相比,p221, pM和pAG菌株的起始粘附能力和對溶葡萄球菌酶的敏感性的差異無統(tǒng)計學(xué)意義,提示細(xì)菌起始粘附
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