脊椎動物基因組的超級保守序列及剪接位點分析.pdf

1、人類基因組計劃是首個被啟動的脊椎動物基因組計劃。接著又有作為模式生物的斑馬魚和小鼠的基因組被測序。目前已經(jīng)有雞、犬、牛、黑猩猩、河豚等越來越多的脊椎動物基因組測序任務(wù)完成。開展脊椎動物的基因組計劃，并通過比較基因組學(xué)的途徑進(jìn)行研究是生物信息學(xué)的一個重要的研究方向。研究的目的一方面是為了更好的識別和描述人類基因組的特征、基因組中的調(diào)控因子尤其是那些突變后會導(dǎo)致人類疾病的因子；另一方面為了更好的認(rèn)識脊椎動物的進(jìn)化機(jī)制，探尋人類相對其它物種具

2、有獨特性的原因。 近年來，關(guān)于脊椎動物物種之間的保守性問題成為熱點問題。人們發(fā)現(xiàn)親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的物種之間通常存在保守的且不編碼任何蛋白質(zhì)的DNA序列，例如脊椎動物基因組的超級保守片段。但是這些超級保守區(qū)域所具備的功能尚不清楚。 本文主要利用Z曲線方法分析了脊椎動物基因組的超級保守片段和剪接位點。由張春霆教授提出的Z曲線方法為分析DNA序列提供了一個直觀的、可視化的工具。Z曲線是一條與DNA序列一一對應(yīng)的三維曲線。