牛亞科家畜GH基因系統(tǒng)分化的研究.pdf

1、本研究以典型群隨機抽樣的方法，采用單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphism,SNP)方法分段測定了18頭雷瓊牛、19頭巴音郭楞州蒙古牛、18頭巴音郭楞州牦牛、16頭獨龍牛、18頭海子水牛和16頭尼里-拉菲水牛(國內(nèi))GH基因序列，通過剪切、連接獲得了整個外顯子核苷酸堿基654bp。結(jié)合GenBank中牛屬普通牛(Bos taurus)(GenBank序列號：M57764 M28453，M27325)、瘤

2、牛(Bos indicus)(GenBank序列號：EF592534，EF592533)、牦牛(Bos grunniens)(GenBank序列號：AY271297，EF154193)、大額牛(Bibos，frontalis)(GenBank序列號：DQ491198)以及亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenBank序列號：DQ307367)、GH基因同源區(qū)資料，并分別運用亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenB

3、ank序列號：DQ307367)和綿羊(Ovis aries) (GeneBank序列號：EF077162)外類群以最大簡約(MP)法與鄰接(NJ)法構(gòu)建分子系統(tǒng)發(fā)育樹。旨在探討牛亞科家畜各畜種GH基因變異特點以及牦牛、大額牛跟我國南北黃牛關(guān)系的親疏，為牛亞科分類學(xué)說的完善和牛亞科家畜進化分化特征提供部分客觀依據(jù)，為研究適應(yīng)進化與分子進化之間的關(guān)系提供局部的原始實驗根據(jù)。 序列分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)雷瓊牛GH基因序列中存在3個變異位點，定

4、義了5種單倍型。在巴音郭楞州蒙古牛GH基因序列中存在2個變異位點，定義了4種單倍型。巴音郭楞州牦牛GH基因序列中存在2個變異位點，定義了3種單倍型。在獨龍牛、海子水牛和尼里-拉菲水牛GH基因序列中沒有發(fā)現(xiàn)變異，僅有一種單倍型。共發(fā)現(xiàn)19個變異位點，其中7個變異位點發(fā)生在第5外顯子區(qū)，占總變異位點的36.8％。證實了牛亞科家畜GH基因第5外顯子區(qū)有著較高的突變率。分別以亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenBank序列號：DQ

5、307367)和綿羊(Ovis aries)(GeneBank序列號：EF077162)作外類群以最大簡約(MP)法與鄰接(NJ)法構(gòu)建的分子系統(tǒng)發(fā)育樹得到基本一致的拓撲結(jié)構(gòu)。分析結(jié)果表明：(1)牛亞科物種中，瘤牛、普通牛、牦牛關(guān)系相對密切，與水牛關(guān)系較遠；牦牛、獨龍牛與我國南北黃牛之間關(guān)系無遠近之分。(2)確認GH基因的分化早于牛亞科中普通牛、瘤牛和牦牛物種的分化。(3)根據(jù)牦牛、大額牛體型外貌特征、核型分析，并結(jié)合已有研究結(jié)果，本研