牛亞科家畜GH基因系統(tǒng)分化的研究.pdf

1、本研究以典型群隨機(jī)抽樣的方法，采用單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphism,SNP)方法分段測(cè)定了18頭雷瓊牛、19頭巴音郭楞州蒙古牛、18頭巴音郭楞州牦牛、16頭獨(dú)龍牛、18頭海子水牛和16頭尼里-拉菲水牛(國(guó)內(nèi))GH基因序列，通過剪切、連接獲得了整個(gè)外顯子核苷酸堿基654bp。結(jié)合GenBank中牛屬普通牛(Bos taurus)(GenBank序列號(hào)：M57764 M28453，M27325)、瘤

2、牛(Bos indicus)(GenBank序列號(hào)：EF592534，EF592533)、牦牛(Bos grunniens)(GenBank序列號(hào)：AY271297，EF154193)、大額牛(Bibos，frontalis)(GenBank序列號(hào)：DQ491198)以及亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenBank序列號(hào)：DQ307367)、GH基因同源區(qū)資料，并分別運(yùn)用亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenB

3、ank序列號(hào)：DQ307367)和綿羊(Ovis aries) (GeneBank序列號(hào)：EF077162)外類群以最大簡(jiǎn)約(MP)法與鄰接(NJ)法構(gòu)建分子系統(tǒng)發(fā)育樹。旨在探討牛亞科家畜各畜種GH基因變異特點(diǎn)以及牦牛、大額牛跟我國(guó)南北黃牛關(guān)系的親疏，為牛亞科分類學(xué)說的完善和牛亞科家畜進(jìn)化分化特征提供部分客觀依據(jù)，為研究適應(yīng)進(jìn)化與分子進(jìn)化之間的關(guān)系提供局部的原始實(shí)驗(yàn)根據(jù)。 序列分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)雷瓊牛GH基因序列中存在3個(gè)變異位點(diǎn)，定

4、義了5種單倍型。在巴音郭楞州蒙古牛GH基因序列中存在2個(gè)變異位點(diǎn)，定義了4種單倍型。巴音郭楞州牦牛GH基因序列中存在2個(gè)變異位點(diǎn)，定義了3種單倍型。在獨(dú)龍牛、海子水牛和尼里-拉菲水牛GH基因序列中沒有發(fā)現(xiàn)變異，僅有一種單倍型。共發(fā)現(xiàn)19個(gè)變異位點(diǎn)，其中7個(gè)變異位點(diǎn)發(fā)生在第5外顯子區(qū)，占總變異位點(diǎn)的36.8％。證實(shí)了牛亞科家畜GH基因第5外顯子區(qū)有著較高的突變率。分別以亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenBank序列號(hào)：DQ

5、307367)和綿羊(Ovis aries)(GeneBank序列號(hào)：EF077162)作外類群以最大簡(jiǎn)約(MP)法與鄰接(NJ)法構(gòu)建的分子系統(tǒng)發(fā)育樹得到基本一致的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。分析結(jié)果表明：(1)牛亞科物種中，瘤牛、普通牛、牦牛關(guān)系相對(duì)密切，與水牛關(guān)系較遠(yuǎn)；牦牛、獨(dú)龍牛與我國(guó)南北黃牛之間關(guān)系無遠(yuǎn)近之分。(2)確認(rèn)GH基因的分化早于牛亞科中普通牛、瘤牛和牦牛物種的分化。(3)根據(jù)牦牛、大額牛體型外貌特征、核型分析，并結(jié)合已有研究結(jié)果，本研