牛亞科家畜GH基因系統(tǒng)分化的研究.pdf

1、本研究以典型群隨機抽樣的方法，采用單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphism,SNP)方法分段測定了18頭雷瓊牛、19頭巴音郭楞州蒙古牛、18頭巴音郭楞州牦牛、16頭獨龍牛、18頭海子水牛和16頭尼里-拉菲水牛(國內)GH基因序列，通過剪切、連接獲得了整個外顯子核苷酸堿基654bp。結合GenBank中牛屬普通牛(Bos taurus)(GenBank序列號：M57764 M28453，M27325)、瘤

2、牛(Bos indicus)(GenBank序列號：EF592534，EF592533)、牦牛(Bos grunniens)(GenBank序列號：AY271297，EF154193)、大額牛(Bibos，frontalis)(GenBank序列號：DQ491198)以及亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenBank序列號：DQ307367)、GH基因同源區(qū)資料，并分別運用亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenB

3、ank序列號：DQ307367)和綿羊(Ovis aries) (GeneBank序列號：EF077162)外類群以最大簡約(MP)法與鄰接(NJ)法構建分子系統(tǒng)發(fā)育樹。旨在探討牛亞科家畜各畜種GH基因變異特點以及牦牛、大額牛跟我國南北黃牛關系的親疏，為牛亞科分類學說的完善和牛亞科家畜進化分化特征提供部分客觀依據，為研究適應進化與分子進化之間的關系提供局部的原始實驗根據。 序列分析結果發(fā)現雷瓊牛GH基因序列中存在3個變異位點，定

4、義了5種單倍型。在巴音郭楞州蒙古牛GH基因序列中存在2個變異位點，定義了4種單倍型。巴音郭楞州牦牛GH基因序列中存在2個變異位點，定義了3種單倍型。在獨龍牛、海子水牛和尼里-拉菲水牛GH基因序列中沒有發(fā)現變異，僅有一種單倍型。共發(fā)現19個變異位點，其中7個變異位點發(fā)生在第5外顯子區(qū)，占總變異位點的36.8％。證實了牛亞科家畜GH基因第5外顯子區(qū)有著較高的突變率。分別以亞洲水牛(Bubalus Bubalis)(GenBank序列號：DQ

5、307367)和綿羊(Ovis aries)(GeneBank序列號：EF077162)作外類群以最大簡約(MP)法與鄰接(NJ)法構建的分子系統(tǒng)發(fā)育樹得到基本一致的拓撲結構。分析結果表明：(1)牛亞科物種中，瘤牛、普通牛、牦牛關系相對密切，與水牛關系較遠；牦牛、獨龍牛與我國南北黃牛之間關系無遠近之分。(2)確認GH基因的分化早于牛亞科中普通牛、瘤牛和牦牛物種的分化。(3)根據牦牛、大額牛體型外貌特征、核型分析，并結合已有研究結果，本研