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文檔簡介
1、研究背景:
近30年來,蛋白質免疫印跡(Western Blotting)一直作為一項常規(guī)實驗技術,在生命科學研究領域中被廣泛應用。其包括凝膠電泳分離,及后續(xù)的免疫檢測兩個主要步驟。
Western Blotting主要用于蛋白質定性和半定量分析,即檢測樣品中目標蛋白的有無、或不同樣品中目的蛋白的差異表達水平。在定性分析中,需首先檢測泳道中是否存在蛋白,以排除系統(tǒng)非正常工作所導致的假陰性;而半定量分析時,則需要校正不
2、同樣品的上樣量以及轉印效率的差別造成的系統(tǒng)誤差。為此,實驗過程中往往需要引入合適內參(loading control)來作為體系對照。目前使用的內參主要有兩種趨勢,一種是采用傳統(tǒng)的管家基因所表達的蛋白即管家蛋白進行免疫反應,將其發(fā)光灰度值作為體系內參;另一種則是采用全蛋白染色法,即將全部上樣蛋白染色后的灰度值作為體系內參。
直接藍71(Direct Blue71,DB71)是一種工業(yè)常用的偶氮染料,2000年Hee-Youn
3、Hong首次發(fā)現(xiàn)該染料在酸性環(huán)境下能進行蛋白染色,并且在弱堿性環(huán)境下易于洗脫。那么,DB71染色是否能作為一種Western Blotting內參,這種染色方法是否會影響后續(xù)的免疫反應,其在天然樣本中的染色范圍與線性程度等,這些問題均需進一步實驗研究。
目的:
本實驗通過與傳統(tǒng)的單一蛋白免疫內參和全蛋白染色內參進行比較,建立基于直接藍71免洗脫染色的蛋白質免疫印跡內參。
方法:
采用三種常見的神經
4、科學研究樣本(人血漿,人少突膠質瘤細胞,大鼠腦組織)系統(tǒng)評估DB71染色法作為Western Blotingt內參的可行性。其中,考馬斯亮藍作為傳統(tǒng)的全蛋白膜染色內參法,β-tubulin作為傳統(tǒng)的蛋白印記免疫內參法,維他命D結合蛋白作為日常實驗中的目的蛋白來與DB71染色法進行對照試驗。每種樣本重復上樣6次,采用相關系數評估其精確性;2.5-40μg的線性蛋白上樣,采用R2來評估方法的線性及線性范圍;共3次技術重復,采用獨立樣本T檢驗
5、來評估DB71染色法與兩組對照內參法的差異和可重復性。
結果:
(1)在少突膠質瘤細胞組中,DB71染色法的精確性和可重復性較考馬斯亮藍膜染色內參法有統(tǒng)計學差異,而大鼠腦組織和人血漿組并未表現(xiàn)明顯差異。
(2)在少突膠質瘤細胞組和大鼠腦組織組中,直接藍71染色法的精確性性和可重復性較β-tubulin免疫內參法有明顯優(yōu)勢,差異有統(tǒng)計學意義。
(3)在少突膠質瘤細胞組和大鼠腦組織組中,未洗脫的直接藍
6、71染色法的精確性和可重復性較未染色的β-tubulin組和維他命D結合蛋白組無統(tǒng)計學差異,結果表明未洗脫的直接藍71對后續(xù)的免疫反應不會造成太大干擾。
(4)在三組樣本的2.5-40μg上樣范圍內,直接藍71染色法線性好,與考馬斯亮藍染膜法和β-tubulin免疫內參法無統(tǒng)計學差異。在血漿樣本中,直接藍71染色法較維他命D結合蛋白組有統(tǒng)計學差異,而維他命D結合蛋白組線性較差,推測其可能在20μg已達到免疫線性上限。
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